More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4188 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 360 aa  712    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  64.74 
 
 		 360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  58.07 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  55.75 
 
 		 350 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0070  monosaccharide-transporting ATPase  55 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0675215  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0103  monosaccharide-transporting ATPase  55.46 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.628662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  52.97 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0989  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  54.02 
 
 		 363 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2649  inner-membrane translocator  54.02 
 
 		 363 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0235  monosaccharide-transporting ATPase  54.97 
 
 		 363 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.802766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2606  monosaccharide-transporting ATPase  51.97 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0369  inner-membrane translocator  52.23 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.823115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  52.15 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0127  inner-membrane translocator  51.71 
 
 		 354 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0126  Monosaccharide-transporting ATPase  52.29 
 
 		 354 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5756  Monosaccharide-transporting ATPase  49.02 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.166974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  50 
 
 		 335 aa  291  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  48.34 
 
 		 341 aa  285  8e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  50 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  50.97 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  50.97 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  47.56 
 
 		 326 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  47.53 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  50.69 
 
 		 319 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  46.77 
 
 		 329 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  49.53 
 
 		 319 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  47.66 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  48.97 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  47.88 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  48.21 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3622  inner-membrane translocator  47.63 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3557  inner-membrane translocator  48.88 
 
 		 329 aa  252  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373061  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 405 aa  186  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  35.45 
 
 		 334 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  35.45 
 
 		 334 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  35.38 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  35.64 
 
 		 363 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.19 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  36.23 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 		 342 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 334 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  39.73 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  38.97 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  38.97 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  38.97 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  38.97 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.97 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  37 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  38.97 
 
 		 311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  38.62 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  38.62 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  38.62 
 
 		 311 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.85 
 
 		 345 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  38.62 
 
 		 311 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 306 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  34.17 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  35.11 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  34.52 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  35.81 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  39.18 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 		 835 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.38 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  38.38 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  37.03 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  41.72 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 309 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.04 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  37.54 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.88 
 
 		 350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  34.45 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.74 
 
 		 324 aa  166  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  34.96 
 
 		 345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  37.25 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  35.36 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  37.14 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  36.01 
 
 		 341 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.85 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32.85 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  33.93 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.44 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  34.65 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0492  Monosaccharide-transporting ATPase  37.93 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302976  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  34.71 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  34.35 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  35.44 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>