More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4336 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
340 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  97.06 
 
 
340 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  68.66 
 
 
337 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  52.56 
 
 
337 aa  315  8e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1585  monosaccharide-transporting ATPase  46.28 
 
 
339 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.089937  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1921  inner-membrane translocator  48.2 
 
 
325 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.354392  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1128  inner-membrane translocator  46.28 
 
 
339 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00298191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1608  inner-membrane translocator  46.28 
 
 
339 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0142264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1505  inner-membrane translocator  46.43 
 
 
339 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739135  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1524  monosaccharide-transporting ATPase  46.43 
 
 
339 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.410765  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4747  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  45.95 
 
 
339 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101541  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  45.78 
 
 
335 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  46.1 
 
 
335 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1235  monosaccharide-transporting ATPase  45.6 
 
 
343 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  0.567135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2456  monosaccharide-transporting ATPase  45.25 
 
 
331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3234  monosaccharide-transporting ATPase  45.25 
 
 
331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0575  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  47.47 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.607461 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1629  monosaccharide-transporting ATPase  46.67 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39320  membrane protein component of ABC ribose transporter  46.43 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640494  normal  0.430548 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4159  Monosaccharide-transporting ATPase  46.8 
 
 
333 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.311787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1958  monosaccharide-transporting ATPase  45.07 
 
 
331 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.350389  normal  0.0245098 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  40.94 
 
 
342 aa  217  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  41.34 
 
 
345 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3344  membrane protein component of ABC ribose transporter  45.13 
 
 
331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1999  ABC ribose transporter, inner membrane subunit  44.63 
 
 
360 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199843  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2261  Monosaccharide-transporting ATPase  44.63 
 
 
351 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3490  monosaccharide-transporting ATPase  44.59 
 
 
331 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.172066  normal  0.267004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  42.39 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4638  inner-membrane translocator  43.09 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  44.63 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.73 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  43.48 
 
 
310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  45.45 
 
 
322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.81 
 
 
310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  44.66 
 
 
311 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  41.05 
 
 
347 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 
835 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  40.96 
 
 
330 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  40.96 
 
 
330 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  40.96 
 
 
330 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
345 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  40 
 
 
345 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  43.69 
 
 
311 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  40 
 
 
345 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2369  ribose ABC transporter, permease protein  44.66 
 
 
330 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2153  inner-membrane translocator  44.34 
 
 
330 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.654738  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  41.86 
 
 
312 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  43.37 
 
 
311 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  43.37 
 
 
311 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1869  putative ribose ABC transporter, permease protein  45.76 
 
 
337 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1856  putative ribose ABC transporter, permease protein  45.76 
 
 
337 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  43.37 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  43.37 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  43.37 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  43.37 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  41.99 
 
 
341 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2021  membrane protein component of ABC ribose transporter  46.02 
 
 
337 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 
311 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  41.64 
 
 
348 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2473  ribose ABC transporter, permease protein  45.42 
 
 
337 aa  206  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  44.17 
 
 
309 aa  205  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  43.04 
 
 
311 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  43.04 
 
 
311 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  38.99 
 
 
334 aa  205  9e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  38.99 
 
 
334 aa  205  9e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  39.29 
 
 
334 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  40.66 
 
 
331 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  39.55 
 
 
314 aa  202  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  42.56 
 
 
334 aa  202  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  42.56 
 
 
342 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  42.23 
 
 
311 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  43 
 
 
324 aa  202  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  42.56 
 
 
342 aa  202  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2131  inner-membrane translocator  42.48 
 
 
338 aa  202  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  44.88 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  42.37 
 
 
345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  43.69 
 
 
314 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  40.51 
 
 
322 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  41.79 
 
 
345 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  38.7 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  40.99 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  44.51 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  39.27 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  44.51 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  40.8 
 
 
323 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  40.43 
 
 
324 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  38.07 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  40.89 
 
 
317 aa  196  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  39.09 
 
 
325 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  45.61 
 
 
327 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  36.51 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  42.22 
 
 
325 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  44.63 
 
 
339 aa  195  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  40.66 
 
 
330 aa  195  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  40.66 
 
 
330 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  40.66 
 
 
330 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  41.67 
 
 
336 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  38.25 
 
 
335 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  38.86 
 
 
333 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  39.23 
 
 
339 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>