More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1524 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1585  monosaccharide-transporting ATPase  97.94 
 
 		 339 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.089937  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4747  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  96.76 
 
 		 339 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101541  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1524  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 339 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.410765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1128  inner-membrane translocator  97.94 
 
 		 339 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00298191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1505  inner-membrane translocator  99.71 
 
 		 339 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1608  inner-membrane translocator  97.94 
 
 		 339 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0142264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1629  monosaccharide-transporting ATPase  97.57 
 
 		 339 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1235  monosaccharide-transporting ATPase  84.5 
 
 		 343 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  0.567135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1999  ABC ribose transporter, inner membrane subunit  86.57 
 
 		 360 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2261  Monosaccharide-transporting ATPase  85.97 
 
 		 351 aa  541  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0575  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  85.98 
 
 		 333 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.607461 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4159  Monosaccharide-transporting ATPase  86.29 
 
 		 333 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2473  ribose ABC transporter, permease protein  89.33 
 
 		 337 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1856  putative ribose ABC transporter, permease protein  89.33 
 
 		 337 aa  507  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1869  putative ribose ABC transporter, permease protein  89.02 
 
 		 337 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2021  membrane protein component of ABC ribose transporter  89.33 
 
 		 337 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2456  monosaccharide-transporting ATPase  76.99 
 
 		 331 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1921  inner-membrane translocator  79.81 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.354392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3234  monosaccharide-transporting ATPase  81.21 
 
 		 331 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39320  membrane protein component of ABC ribose transporter  82.64 
 
 		 332 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640494  normal  0.430548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3490  monosaccharide-transporting ATPase  81.21 
 
 		 331 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.172066  normal  0.267004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1958  monosaccharide-transporting ATPase  80.56 
 
 		 331 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.350389  normal  0.0245098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3344  membrane protein component of ABC ribose transporter  81.79 
 
 		 331 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2369  ribose ABC transporter, permease protein  78.91 
 
 		 330 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2153  inner-membrane translocator  78.91 
 
 		 330 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.654738  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  72.64 
 
 		 335 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  72.64 
 
 		 335 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4638  inner-membrane translocator  66.56 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1015  transmembrane ABC transporter protein  75.53 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4198  inner-membrane translocator  66.56 
 
 		 329 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.778968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2131  inner-membrane translocator  64.84 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  46.43 
 
 		 340 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  45.78 
 
 		 340 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 337 aa  226  6e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  43.1 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  40.58 
 
 		 345 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 345 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 345 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  38.73 
 
 		 345 aa  192  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.73 
 
 		 345 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 345 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  40.46 
 
 		 339 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  40.66 
 
 		 324 aa  185  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  39.33 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  39.5 
 
 		 342 aa  182  7e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  37.5 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  37.65 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  38.71 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  40.06 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 338 aa  176  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.78 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  38.48 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  39.21 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  34.21 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  36.74 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  38.31 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  41.25 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 405 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  41.25 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  41.58 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  41.58 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  38.54 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  37.28 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  38.54 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.12 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  35.86 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  36.61 
 
 		 335 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  37.33 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  38.62 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  36.2 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  36.2 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  36.2 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  36.2 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  36.2 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  36.2 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  35.45 
 
 		 328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  36.2 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  36.2 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  41.58 
 
 		 344 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  39.41 
 
 		 314 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 340 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3322  monosaccharide-transporting ATPase  39.2 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.897327  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  38.11 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.11 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.3 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  37.24 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.3 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  38.68 
 
 		 322 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  37.7 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  37.34 
 
 		 835 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>