More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1958 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1958  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
331 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.350389  normal  0.0245098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2456  monosaccharide-transporting ATPase  94.86 
 
 
331 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3234  monosaccharide-transporting ATPase  94.86 
 
 
331 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3490  monosaccharide-transporting ATPase  94.86 
 
 
331 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.172066  normal  0.267004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1921  inner-membrane translocator  87.85 
 
 
325 aa  552  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.354392  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2369  ribose ABC transporter, permease protein  84.85 
 
 
330 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2153  inner-membrane translocator  84.55 
 
 
330 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.654738  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39320  membrane protein component of ABC ribose transporter  86.35 
 
 
332 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640494  normal  0.430548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3344  membrane protein component of ABC ribose transporter  85.85 
 
 
331 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1524  monosaccharide-transporting ATPase  80.56 
 
 
339 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.410765  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1128  inner-membrane translocator  80.56 
 
 
339 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00298191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1505  inner-membrane translocator  80.56 
 
 
339 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1608  inner-membrane translocator  80.56 
 
 
339 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0142264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1585  monosaccharide-transporting ATPase  80.56 
 
 
339 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.089937  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4747  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  78.98 
 
 
339 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101541  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2261  Monosaccharide-transporting ATPase  80 
 
 
351 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1999  ABC ribose transporter, inner membrane subunit  80.8 
 
 
360 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199843  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4159  Monosaccharide-transporting ATPase  78.22 
 
 
333 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.311787 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1629  monosaccharide-transporting ATPase  79.88 
 
 
339 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0575  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  78.82 
 
 
333 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.607461 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1235  monosaccharide-transporting ATPase  80.32 
 
 
343 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  0.567135 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2473  ribose ABC transporter, permease protein  76.42 
 
 
337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  69.39 
 
 
335 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  69.39 
 
 
335 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1856  putative ribose ABC transporter, permease protein  77.01 
 
 
337 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1869  putative ribose ABC transporter, permease protein  76.72 
 
 
337 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2021  membrane protein component of ABC ribose transporter  76.72 
 
 
337 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4638  inner-membrane translocator  67.86 
 
 
327 aa  391  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4198  inner-membrane translocator  71.15 
 
 
329 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.778968  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1015  transmembrane ABC transporter protein  73.5 
 
 
348 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2131  inner-membrane translocator  66.15 
 
 
338 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  43.96 
 
 
337 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  45.9 
 
 
340 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  46.23 
 
 
340 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  42.69 
 
 
337 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  41.12 
 
 
342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  37.83 
 
 
345 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  37.83 
 
 
345 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  37.83 
 
 
345 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  37.42 
 
 
405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.83 
 
 
345 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  38.28 
 
 
310 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  41.83 
 
 
345 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  36.84 
 
 
345 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.5 
 
 
345 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  41.83 
 
 
345 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  41.83 
 
 
345 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  41.83 
 
 
345 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  36.63 
 
 
334 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  38.34 
 
 
345 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  39.73 
 
 
328 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  37.38 
 
 
324 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 
339 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  41.83 
 
 
345 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  41.83 
 
 
345 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  37.34 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  36.79 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  40.97 
 
 
330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  41.83 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  38.29 
 
 
314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  41.83 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  38.71 
 
 
313 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.61 
 
 
333 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  38.24 
 
 
338 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  41.26 
 
 
333 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  41.69 
 
 
340 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  37.27 
 
 
341 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  36.86 
 
 
331 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.6 
 
 
312 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
339 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  37.33 
 
 
322 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  38.59 
 
 
336 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  38.19 
 
 
336 aa  169  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  36.81 
 
 
328 aa  169  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  33.97 
 
 
341 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 
311 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 
311 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.99 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.99 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 
346 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  36.79 
 
 
331 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.09 
 
 
328 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  35.33 
 
 
346 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  36.58 
 
 
342 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.67 
 
 
311 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.67 
 
 
311 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  35.93 
 
 
314 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  37.46 
 
 
322 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  36.58 
 
 
334 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3322  monosaccharide-transporting ATPase  38.18 
 
 
327 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.897327  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  36.58 
 
 
342 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  38.33 
 
 
322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.98 
 
 
309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
311 aa  165  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  38.78 
 
 
318 aa  166  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  37.58 
 
 
324 aa  165  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
311 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  37.03 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.67 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>