More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0945 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 335 aa  644    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  99.4 
 
 		 335 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1015  transmembrane ABC transporter protein  84.78 
 
 		 348 aa  454  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1585  monosaccharide-transporting ATPase  73.27 
 
 		 339 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.089937  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1128  inner-membrane translocator  73.27 
 
 		 339 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00298191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1505  inner-membrane translocator  72.64 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1608  inner-membrane translocator  73.27 
 
 		 339 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0142264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1524  monosaccharide-transporting ATPase  72.64 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.410765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2456  monosaccharide-transporting ATPase  69.09 
 
 		 331 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4747  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  72.96 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101541  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3234  monosaccharide-transporting ATPase  69.09 
 
 		 331 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1921  inner-membrane translocator  69.47 
 
 		 325 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.354392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3344  membrane protein component of ABC ribose transporter  73.09 
 
 		 331 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2261  Monosaccharide-transporting ATPase  70.61 
 
 		 351 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1999  ABC ribose transporter, inner membrane subunit  71.25 
 
 		 360 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1629  monosaccharide-transporting ATPase  71.04 
 
 		 339 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39320  membrane protein component of ABC ribose transporter  74.35 
 
 		 332 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640494  normal  0.430548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1958  monosaccharide-transporting ATPase  69.39 
 
 		 331 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.350389  normal  0.0245098 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0575  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  69.85 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.607461 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4159  Monosaccharide-transporting ATPase  71.25 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1235  monosaccharide-transporting ATPase  70.78 
 
 		 343 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  0.567135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3490  monosaccharide-transporting ATPase  68.79 
 
 		 331 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.172066  normal  0.267004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2369  ribose ABC transporter, permease protein  68.31 
 
 		 330 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2153  inner-membrane translocator  68.62 
 
 		 330 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.654738  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2473  ribose ABC transporter, permease protein  71.65 
 
 		 337 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1856  putative ribose ABC transporter, permease protein  72.53 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1869  putative ribose ABC transporter, permease protein  72.22 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2021  membrane protein component of ABC ribose transporter  72.22 
 
 		 337 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4638  inner-membrane translocator  63.43 
 
 		 327 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4198  inner-membrane translocator  65.9 
 
 		 329 aa  348  9e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.778968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2131  inner-membrane translocator  59.69 
 
 		 338 aa  338  7e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  41.54 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  46.1 
 
 		 340 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  46.35 
 
 		 340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  43.92 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  42.96 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  37.86 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  39.7 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  39.7 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  39.7 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  38.92 
 
 		 342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  36.68 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  39.64 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.47 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  36.39 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  36.09 
 
 		 345 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  40.2 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  41.06 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  41.06 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  39.75 
 
 		 345 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  36.39 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  39.25 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  35.88 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  39.25 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  38.96 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.63 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  39.63 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  38.94 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  37.76 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  39.63 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  36.61 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  38.72 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  40.21 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  36.86 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  40.59 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  39.4 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3322  monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.897327  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  40.98 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  41.39 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  37.91 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.85 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  38.21 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 325 aa  166  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  40.39 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.87 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  34.85 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  34.55 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  40.27 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 835 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5600  ribose transport system permease protein RbsC  37.12 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  34.55 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>