More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4638 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4638  inner-membrane translocator  100 
 
 		 327 aa  620  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2131  inner-membrane translocator  81.13 
 
 		 338 aa  458  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4198  inner-membrane translocator  80.19 
 
 		 329 aa  441  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.778968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2456  monosaccharide-transporting ATPase  66.23 
 
 		 331 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4747  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  66.56 
 
 		 339 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101541  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0575  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  66.56 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.607461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3234  monosaccharide-transporting ATPase  66.23 
 
 		 331 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4159  Monosaccharide-transporting ATPase  66.56 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1524  monosaccharide-transporting ATPase  66.56 
 
 		 339 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.410765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1585  monosaccharide-transporting ATPase  66.23 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.089937  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1921  inner-membrane translocator  64.61 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.354392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1128  inner-membrane translocator  66.23 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00298191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1505  inner-membrane translocator  66.56 
 
 		 339 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1608  inner-membrane translocator  66.23 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0142264  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3344  membrane protein component of ABC ribose transporter  64.83 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1235  monosaccharide-transporting ATPase  66.24 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  0.567135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1958  monosaccharide-transporting ATPase  67.86 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.350389  normal  0.0245098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39320  membrane protein component of ABC ribose transporter  66.88 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640494  normal  0.430548 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1629  monosaccharide-transporting ATPase  67.23 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2261  Monosaccharide-transporting ATPase  63.5 
 
 		 351 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1999  ABC ribose transporter, inner membrane subunit  63.95 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3490  monosaccharide-transporting ATPase  66.23 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.172066  normal  0.267004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  62.65 
 
 		 335 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2369  ribose ABC transporter, permease protein  62.66 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2153  inner-membrane translocator  62.34 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.654738  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  62.35 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2473  ribose ABC transporter, permease protein  65.3 
 
 		 337 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1856  putative ribose ABC transporter, permease protein  64.58 
 
 		 337 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1869  putative ribose ABC transporter, permease protein  64.26 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2021  membrane protein component of ABC ribose transporter  64.26 
 
 		 337 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1015  transmembrane ABC transporter protein  64.18 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  43.41 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  43.09 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  43.61 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  40.47 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  41.08 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  40.74 
 
 		 342 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  40.74 
 
 		 342 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  39.27 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  36.84 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  39.27 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  38.77 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  39.27 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 345 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 345 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  37.29 
 
 		 345 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  41.8 
 
 		 336 aa  185  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  39.43 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.29 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  41.78 
 
 		 348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  36.86 
 
 		 328 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 347 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  36 
 
 		 331 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  39.35 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  38.83 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  38.83 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  38.83 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  38.83 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  38.83 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  36.33 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  38.51 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  38.83 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  38.51 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  42.04 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  42.04 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  42.04 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  37 
 
 		 324 aa  176  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  42.99 
 
 		 345 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.72 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  37.23 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  42.99 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  38.51 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.12 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  38.11 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  40.5 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 334 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 340 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  40.67 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.79 
 
 		 310 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5600  ribose transport system permease protein RbsC  35.54 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  42.36 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  42.36 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  39.64 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  38.31 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  39.67 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  39.67 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  39.67 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  39.67 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  39.67 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.86 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>