More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4198 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4198  inner-membrane translocator  100 
 
 
329 aa  627  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.778968  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2131  inner-membrane translocator  86.56 
 
 
338 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4638  inner-membrane translocator  82.47 
 
 
327 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2456  monosaccharide-transporting ATPase  71.15 
 
 
331 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3234  monosaccharide-transporting ATPase  71.15 
 
 
331 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1958  monosaccharide-transporting ATPase  71.15 
 
 
331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.350389  normal  0.0245098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1921  inner-membrane translocator  66.99 
 
 
325 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.354392  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3490  monosaccharide-transporting ATPase  70.26 
 
 
331 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.172066  normal  0.267004 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1524  monosaccharide-transporting ATPase  66.56 
 
 
339 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.410765  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1585  monosaccharide-transporting ATPase  66.45 
 
 
339 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.089937  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1128  inner-membrane translocator  66.45 
 
 
339 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00298191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1505  inner-membrane translocator  64.44 
 
 
339 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1608  inner-membrane translocator  66.45 
 
 
339 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0142264  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2261  Monosaccharide-transporting ATPase  65.53 
 
 
351 aa  391  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1235  monosaccharide-transporting ATPase  65.34 
 
 
343 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  0.567135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0575  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  63.77 
 
 
333 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.607461 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4159  Monosaccharide-transporting ATPase  63.77 
 
 
333 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.311787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3344  membrane protein component of ABC ribose transporter  65.34 
 
 
331 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4747  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  65.81 
 
 
339 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101541  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1999  ABC ribose transporter, inner membrane subunit  64.91 
 
 
360 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199843  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39320  membrane protein component of ABC ribose transporter  68.52 
 
 
332 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640494  normal  0.430548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2369  ribose ABC transporter, permease protein  65.9 
 
 
330 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2153  inner-membrane translocator  63.27 
 
 
330 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.654738  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1629  monosaccharide-transporting ATPase  64.6 
 
 
339 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  67.1 
 
 
335 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  67.43 
 
 
335 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2473  ribose ABC transporter, permease protein  64.6 
 
 
337 aa  360  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1856  putative ribose ABC transporter, permease protein  66.23 
 
 
337 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1869  putative ribose ABC transporter, permease protein  65.91 
 
 
337 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2021  membrane protein component of ABC ribose transporter  65.91 
 
 
337 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1015  transmembrane ABC transporter protein  67.02 
 
 
348 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  44.95 
 
 
337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  40.36 
 
 
340 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  42.26 
 
 
340 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  39.64 
 
 
337 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  35.23 
 
 
345 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  35.23 
 
 
345 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  37.22 
 
 
345 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  37.31 
 
 
342 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  35.23 
 
 
345 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.23 
 
 
345 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  35.34 
 
 
345 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  38.08 
 
 
335 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  38.66 
 
 
334 aa  185  9e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  38.34 
 
 
342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  36.72 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  38.34 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  35.96 
 
 
339 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  40.53 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  39.13 
 
 
345 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  40.66 
 
 
336 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  36.75 
 
 
331 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  41.25 
 
 
345 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  40.59 
 
 
345 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  40.59 
 
 
345 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  40.29 
 
 
345 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  40.29 
 
 
345 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  43.46 
 
 
339 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  40.29 
 
 
345 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  34.62 
 
 
333 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.83 
 
 
345 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  37.35 
 
 
330 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  37.35 
 
 
330 aa  175  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  37.35 
 
 
330 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  34.94 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  37.81 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  42.81 
 
 
344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  42.81 
 
 
344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  39.53 
 
 
348 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  34.52 
 
 
341 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  41.69 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  38.73 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  39.43 
 
 
327 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  37.11 
 
 
313 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  38.26 
 
 
345 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  34.77 
 
 
310 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  36.34 
 
 
341 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  40.14 
 
 
333 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.45 
 
 
324 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 
311 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  42.81 
 
 
344 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2034  Monosaccharide-transporting ATPase  43.85 
 
 
326 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0584323  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.58 
 
 
333 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  38.01 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  37.14 
 
 
311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.46 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  37.46 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  37.14 
 
 
311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  37.88 
 
 
323 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  37.14 
 
 
311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  37.14 
 
 
311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  37.14 
 
 
311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  34.08 
 
 
315 aa  165  8e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  38.59 
 
 
336 aa  165  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.8 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  35.56 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.81 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.56 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.83 
 
 
311 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>