More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1015 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1015  transmembrane ABC transporter protein  100 
 
 		 348 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  85.13 
 
 		 335 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  84.84 
 
 		 335 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1585  monosaccharide-transporting ATPase  71.26 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.089937  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1128  inner-membrane translocator  71.26 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00298191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1608  inner-membrane translocator  71.26 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0142264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4747  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  70.66 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101541  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1505  inner-membrane translocator  70.27 
 
 		 339 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739135  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1524  monosaccharide-transporting ATPase  70.27 
 
 		 339 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.410765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2456  monosaccharide-transporting ATPase  72.28 
 
 		 331 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3234  monosaccharide-transporting ATPase  72.28 
 
 		 331 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1921  inner-membrane translocator  71.62 
 
 		 325 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.354392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2261  Monosaccharide-transporting ATPase  69.62 
 
 		 351 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1629  monosaccharide-transporting ATPase  70.86 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4159  Monosaccharide-transporting ATPase  69.85 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1999  ABC ribose transporter, inner membrane subunit  69.94 
 
 		 360 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0575  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  69.85 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.607461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3344  membrane protein component of ABC ribose transporter  70.15 
 
 		 331 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1235  monosaccharide-transporting ATPase  67.15 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  0.567135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3490  monosaccharide-transporting ATPase  73.15 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.172066  normal  0.267004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1958  monosaccharide-transporting ATPase  69.02 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.350389  normal  0.0245098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39320  membrane protein component of ABC ribose transporter  72.22 
 
 		 332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640494  normal  0.430548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2369  ribose ABC transporter, permease protein  69.21 
 
 		 330 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2153  inner-membrane translocator  69.65 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.654738  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1856  putative ribose ABC transporter, permease protein  75.43 
 
 		 337 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2473  ribose ABC transporter, permease protein  75.09 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1869  putative ribose ABC transporter, permease protein  75.09 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2021  membrane protein component of ABC ribose transporter  75.09 
 
 		 337 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4198  inner-membrane translocator  62.77 
 
 		 329 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.778968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2131  inner-membrane translocator  62.17 
 
 		 338 aa  335  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4638  inner-membrane translocator  62.5 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  45.71 
 
 		 340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  45.86 
 
 		 340 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  44.21 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.54 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  37.15 
 
 		 345 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  37.29 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  37.11 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 324 aa  179  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  38.78 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  41.24 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 405 aa  173  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  41.45 
 
 		 336 aa  173  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  35.29 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.84 
 
 		 350 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.55 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  37.22 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  40.67 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  39.48 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  39.73 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  38.61 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  38.46 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  37.41 
 
 		 328 aa  165  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  39.86 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  37.66 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  38.48 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  39.02 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  39.02 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  39.02 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  39.79 
 
 		 323 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  39.35 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  35.28 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  39.23 
 
 		 339 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.14 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  39.8 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 335 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  38.36 
 
 		 348 aa  162  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  37.86 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  39.54 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  36.08 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  39.87 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  39.87 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  34.35 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3429  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00479151  hitchhiker  0.0000975841 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  37.91 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  34.35 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 383 aa  159  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  38.71 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  37.75 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  38.08 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>