More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4159 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4159  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 333 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0575  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  98.8 
 
 		 333 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.607461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4747  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  86.29 
 
 		 339 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101541  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1128  inner-membrane translocator  86.29 
 
 		 339 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00298191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1505  inner-membrane translocator  86.29 
 
 		 339 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739135  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1524  monosaccharide-transporting ATPase  86.29 
 
 		 339 aa  534  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.410765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1608  inner-membrane translocator  86.29 
 
 		 339 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0142264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1585  monosaccharide-transporting ATPase  86.29 
 
 		 339 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.089937  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2261  Monosaccharide-transporting ATPase  84.88 
 
 		 351 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1999  ABC ribose transporter, inner membrane subunit  84.57 
 
 		 360 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1629  monosaccharide-transporting ATPase  85.71 
 
 		 339 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1235  monosaccharide-transporting ATPase  81.02 
 
 		 343 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  0.567135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3234  monosaccharide-transporting ATPase  78.82 
 
 		 331 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2456  monosaccharide-transporting ATPase  78.82 
 
 		 331 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1921  inner-membrane translocator  80.45 
 
 		 325 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.354392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2473  ribose ABC transporter, permease protein  84.49 
 
 		 337 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3344  membrane protein component of ABC ribose transporter  78.79 
 
 		 331 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39320  membrane protein component of ABC ribose transporter  82.52 
 
 		 332 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640494  normal  0.430548 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1856  putative ribose ABC transporter, permease protein  85.13 
 
 		 337 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1869  putative ribose ABC transporter, permease protein  84.81 
 
 		 337 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3490  monosaccharide-transporting ATPase  78.33 
 
 		 331 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.172066  normal  0.267004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1958  monosaccharide-transporting ATPase  78.22 
 
 		 331 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.350389  normal  0.0245098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2021  membrane protein component of ABC ribose transporter  84.81 
 
 		 337 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2369  ribose ABC transporter, permease protein  75.69 
 
 		 330 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2153  inner-membrane translocator  76 
 
 		 330 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.654738  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  70.95 
 
 		 335 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  70.95 
 
 		 335 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4638  inner-membrane translocator  68.75 
 
 		 327 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1015  transmembrane ABC transporter protein  73.85 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4198  inner-membrane translocator  64.94 
 
 		 329 aa  363  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.778968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2131  inner-membrane translocator  64.54 
 
 		 338 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  42.56 
 
 		 337 aa  228  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  46.84 
 
 		 340 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  46.84 
 
 		 340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  42.09 
 
 		 337 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 345 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 345 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  37.98 
 
 		 345 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  38.82 
 
 		 345 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.22 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  40.92 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  38.62 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  43.04 
 
 		 324 aa  185  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  38.13 
 
 		 347 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  36.27 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  37.37 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.61 
 
 		 350 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  41.18 
 
 		 345 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  36.42 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  38.19 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  38.26 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.37 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  40.98 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  41.18 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  38.66 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  41.18 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  36.1 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  36.79 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  37.8 
 
 		 342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  37.8 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  39.08 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  36.1 
 
 		 346 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.39 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  40 
 
 		 314 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  40.33 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  38.14 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  39.45 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  37.73 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  34.37 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 331 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  38.04 
 
 		 327 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 345 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  41.18 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  39.79 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  38.99 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  36.96 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  38.57 
 
 		 353 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  37.58 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  38.21 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  35.4 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  38.29 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.13 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>