More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0974 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
313 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  51.24 
 
 
322 aa  256  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  50.71 
 
 
327 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  46.96 
 
 
311 aa  256  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  46.15 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1666  Monosaccharide-transporting ATPase  50.79 
 
 
327 aa  253  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  46.15 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  46.15 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 
311 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  46.15 
 
 
311 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  46.15 
 
 
311 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 
311 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 
311 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  46.01 
 
 
333 aa  249  6e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  47.67 
 
 
336 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  48.25 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  49.19 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  48.52 
 
 
350 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  51.38 
 
 
319 aa  242  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  42.21 
 
 
323 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  47.12 
 
 
332 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  45.75 
 
 
324 aa  239  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  45.66 
 
 
314 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  47.14 
 
 
311 aa  238  8e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  43.91 
 
 
312 aa  238  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  43 
 
 
317 aa  236  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  43.44 
 
 
342 aa  235  6e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  44.18 
 
 
306 aa  233  3e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  47.97 
 
 
336 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  41.88 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  43.37 
 
 
330 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  43.37 
 
 
330 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  43.37 
 
 
330 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  42.53 
 
 
309 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.3 
 
 
310 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  43.49 
 
 
328 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  41.97 
 
 
348 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  41.97 
 
 
310 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  43.87 
 
 
318 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  44.84 
 
 
342 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  45.34 
 
 
345 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  41.78 
 
 
328 aa  225  7e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  42.38 
 
 
835 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1602  monosaccharide-transporting ATPase  45.75 
 
 
349 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  44.85 
 
 
332 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  42.36 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  42.36 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  42.49 
 
 
315 aa  222  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  42.59 
 
 
334 aa  222  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  42.96 
 
 
334 aa  222  8e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  42.96 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  42.96 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  44.55 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  43.83 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  41.53 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  42.44 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  43.09 
 
 
335 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  46.42 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  40.66 
 
 
319 aa  218  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  43.37 
 
 
310 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  41.2 
 
 
315 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  42.38 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  40.06 
 
 
346 aa  216  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  42.9 
 
 
322 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2716  high-affinity D-ribose ABC transporter membrane protein  40.65 
 
 
365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139094  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  42.86 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  39.49 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  42.16 
 
 
334 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  40.68 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  44.56 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  44.41 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  42.32 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  41.31 
 
 
322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  41.61 
 
 
332 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  40.51 
 
 
345 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  41.98 
 
 
317 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  43.45 
 
 
323 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  44.73 
 
 
349 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  39.41 
 
 
345 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  39.41 
 
 
345 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  39.41 
 
 
345 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  41.56 
 
 
333 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.41 
 
 
345 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
326 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  40.87 
 
 
332 aa  208  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  41.81 
 
 
339 aa  209  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  39.55 
 
 
345 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  41.59 
 
 
341 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  44.92 
 
 
348 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  38.44 
 
 
327 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  39.74 
 
 
343 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  43.61 
 
 
341 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  39.17 
 
 
317 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  43.06 
 
 
322 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  39.74 
 
 
343 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  44.18 
 
 
338 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  41.35 
 
 
316 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  41.5 
 
 
332 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.868986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>