More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2448 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  100 
 
 		 327 aa  636    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  38.78 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  41.28 
 
 		 323 aa  205  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  43.94 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  40.38 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  40.38 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.44 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40.38 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40.06 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40.06 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  40.06 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  38.43 
 
 		 327 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  39.74 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  39.74 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  40.96 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  39.52 
 
 		 309 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  40.34 
 
 		 309 aa  198  7.999999999999999e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  40.86 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  36.73 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  39.73 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.37 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.37 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.62 
 
 		 350 aa  192  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  41.41 
 
 		 327 aa  192  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  41.08 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  36.25 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 		 335 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  35.81 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  38.89 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  36.21 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  40.74 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  39.09 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  41.07 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 323 aa  185  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  40.75 
 
 		 331 aa  185  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  39.12 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  36.49 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  38.05 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  37.99 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  34.29 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 331 aa  182  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.55 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1363  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  33.88 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  39.09 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  36.77 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  36.43 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 316 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 320 aa  179  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  33 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  37.99 
 
 		 322 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  35.87 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  34.42 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  34.42 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  36.71 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 337 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 337 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  33.77 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  38.54 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.41 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  37.7 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  39 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  39 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  39 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  39 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  39 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  39 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1666  Monosaccharide-transporting ATPase  40.53 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  39 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  39 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  38.67 
 
 		 321 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  38.67 
 
 		 321 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>