More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1363 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1363  inner-membrane translocator  100 
 
 		 332 aa  638    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  36.88 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.77 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.77 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.77 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 326 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.05 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  36.88 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.05 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  36.88 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 317 aa  176  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  34.78 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.03 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  36.04 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  35.17 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.04 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  38.16 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  36.04 
 
 		 333 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.71 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.63 
 
 		 350 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.71 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  35 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.39 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.39 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.39 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 328 aa  166  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  34.69 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  37.55 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  34.97 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2907  Monosaccharide-transporting ATPase  38.18 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0357751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 		 348 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  34.76 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  34.76 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  34.76 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  34.76 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.38 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  32.91 
 
 		 355 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  32.37 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 346 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  31.83 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  32.99 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.46 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  31.89 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1602  monosaccharide-transporting ATPase  34.24 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 346 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  33.64 
 
 		 360 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 357 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  32.65 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  32.89 
 
 		 351 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 339 aa  158  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  32.89 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  32.36 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  34.1 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.31 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  32.89 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  31.46 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  33.23 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  30.06 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  31.05 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  32.94 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  30.09 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  33.63 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>