More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4325 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  100 
 
 
355 aa  660    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2736  inner-membrane translocator  53.42 
 
 
328 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.804155  normal  0.636312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  44.51 
 
 
339 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  45.21 
 
 
336 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  42.52 
 
 
336 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  36.22 
 
 
317 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  36.61 
 
 
345 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 
346 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.13 
 
 
345 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  36.34 
 
 
341 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  38.46 
 
 
333 aa  185  9e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  38.69 
 
 
346 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  35.42 
 
 
345 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  35.42 
 
 
345 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  35.42 
 
 
345 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  35.91 
 
 
345 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  41.28 
 
 
327 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  35.37 
 
 
314 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  42.56 
 
 
319 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  35.22 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  36.14 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  37.38 
 
 
312 aa  180  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  40.76 
 
 
835 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  36.96 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  36.78 
 
 
330 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  38.22 
 
 
327 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1666  Monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
327 aa  179  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  34.85 
 
 
323 aa  178  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  38.94 
 
 
333 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  37.63 
 
 
339 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  40.59 
 
 
310 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  36.57 
 
 
331 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  37.85 
 
 
337 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.26 
 
 
310 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  35.91 
 
 
333 aa  176  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  38.59 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  39.44 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  37.82 
 
 
317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  37.06 
 
 
330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  37.82 
 
 
317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  39.5 
 
 
315 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  37.17 
 
 
350 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  36.82 
 
 
328 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  38.23 
 
 
353 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  37.75 
 
 
318 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  37.92 
 
 
353 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 
311 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  37.57 
 
 
347 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.02 
 
 
350 aa  169  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  34.26 
 
 
345 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  35.83 
 
 
383 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  39.69 
 
 
341 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  36.17 
 
 
342 aa  168  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  39.07 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.6 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  39.43 
 
 
334 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  37.35 
 
 
358 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  37.38 
 
 
334 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  36.01 
 
 
320 aa  167  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  36.34 
 
 
342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  40.84 
 
 
329 aa  165  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  36.53 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  35.76 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3074  monosaccharide-transporting ATPase  35.98 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  32.84 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  35.06 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  38.64 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  38.61 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3645  inner-membrane translocator  36.59 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.45 
 
 
333 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0392  inner-membrane translocator  36.1 
 
 
349 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  36.28 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  39.26 
 
 
339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  36.75 
 
 
328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  35.58 
 
 
325 aa  162  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  34.7 
 
 
318 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 
329 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  34.21 
 
 
342 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 
342 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  36.47 
 
 
335 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.37 
 
 
309 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  36.52 
 
 
348 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  35.63 
 
 
342 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  34.74 
 
 
334 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  35.63 
 
 
342 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  35.63 
 
 
342 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  37.79 
 
 
310 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  36.04 
 
 
322 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  35.81 
 
 
328 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5596  monosaccharide-transporting ATPase  35.57 
 
 
341 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0371  inner-membrane translocator  38.02 
 
 
338 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  36.17 
 
 
335 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  35.52 
 
 
336 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  36.63 
 
 
333 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  37.33 
 
 
338 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  39.14 
 
 
342 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  35.11 
 
 
324 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  37.42 
 
 
314 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>