More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2042 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 328 aa  646    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3431  inner-membrane translocator  51.4 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  35.89 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 344 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  34.59 
 
 		 385 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 314 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 373 aa  169  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  36.99 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  32.29 
 
 		 374 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.94 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.62 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.29 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.29 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  35.18 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  32.01 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.97 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.97 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  39.04 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  31.55 
 
 		 375 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 406 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  35.14 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  34.46 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  30.2 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  31.62 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  36.42 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  38.23 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.98 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  34.59 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  34.73 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.94 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  35.8 
 
 		 355 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  34.62 
 
 		 346 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5242  monosaccharide-transporting ATPase  34.65 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 334 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 334 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  40.08 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  35.45 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.28 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  34.62 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  35.24 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.31 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 333 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 317 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  32.82 
 
 		 328 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 383 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  32.28 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.13 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 333 aa  149  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  33.93 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3557  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373061  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.54 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  36.63 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  32.9 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  34.75 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  32.92 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  35 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  34.28 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  36.67 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  34.64 
 
 		 377 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.51 
 
 		 338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.61 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 343 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 343 aa  145  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  35.92 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  34.27 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  32.52 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.67 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>