More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4493 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 377 aa  741    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  47.19 
 
 		 346 aa  282  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  47.51 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  45.64 
 
 		 347 aa  252  7e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  44.54 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  44.54 
 
 		 375 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  47.81 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  41.8 
 
 		 376 aa  243  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  41.93 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  39.95 
 
 		 373 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 352 aa  235  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  40.76 
 
 		 373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  39.89 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  41.71 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  43.29 
 
 		 353 aa  229  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  42.49 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  41.87 
 
 		 349 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  40.46 
 
 		 352 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  42.94 
 
 		 344 aa  222  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  39.03 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  39.44 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  40.36 
 
 		 352 aa  219  6e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  42.25 
 
 		 355 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  39.38 
 
 		 385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  46.34 
 
 		 353 aa  216  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 406 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  39.83 
 
 		 373 aa  213  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  42.37 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  41.84 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  38.86 
 
 		 374 aa  207  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  38.64 
 
 		 385 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  40.36 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  37.53 
 
 		 385 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.12 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  39.68 
 
 		 374 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  39.68 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  39.68 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  39.68 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  39.68 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  39.68 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  39.68 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  39.14 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.29 
 
 		 346 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  33.14 
 
 		 353 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 348 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 		 353 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  30.61 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1920  putative ABC transporter transmembrane transport protein  30.22 
 
 		 417 aa  123  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.471458  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  29.28 
 
 		 345 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.52 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5338  inner-membrane translocator  31 
 
 		 409 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 345 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 345 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0914  monosaccharide-transporting ATPase  34.34 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5291  inner-membrane translocator  28.69 
 
 		 425 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362789 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0479  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  32.83 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0714563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4065  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  32.83 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.937045  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0151  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  32.83 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.302956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  29.89 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0780  inner-membrane translocator  27.36 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  31.6 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  29.13 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  29.22 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  29.18 
 
 		 347 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3848  inner-membrane translocator  27.89 
 
 		 420 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  32.57 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4853  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  30.25 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  28.68 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  29.34 
 
 		 835 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5750  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  30.14 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  29.84 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  28.68 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4708  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  30.14 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4484  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  30.14 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04099  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  29.79 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  27.45 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04063  hypothetical protein  29.79 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4800  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  29.79 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  29.34 
 
 		 310 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3780  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  29.79 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.948724  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3763  Monosaccharide-transporting ATPase  29.79 
 
 		 331 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 339 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1602  monosaccharide-transporting ATPase  33.57 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4338  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 411 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  28.68 
 
 		 394 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 316 aa  109  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>