More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4227 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 326 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  79.44 
 
 		 332 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  81.61 
 
 		 332 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  79.13 
 
 		 332 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  79.44 
 
 		 332 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  81.61 
 
 		 332 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  81.61 
 
 		 332 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  81.61 
 
 		 332 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  81.61 
 
 		 332 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  70.51 
 
 		 335 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1375  inner-membrane translocator  61.34 
 
 		 336 aa  354  8.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  42.81 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  42.48 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  42.48 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  42.67 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  42.67 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  42.67 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  42.35 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  42.35 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  42.35 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  42.35 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  41.83 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.51 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  39.43 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.27 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  40.91 
 
 		 350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  40.91 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  40.91 
 
 		 342 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  40.91 
 
 		 342 aa  198  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  39.01 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  38.44 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6163  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000865468 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  38.74 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  39.93 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  39.12 
 
 		 331 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7476  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.38 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  39.42 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  35.6 
 
 		 333 aa  192  6e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  42.29 
 
 		 327 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  37.31 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  39.42 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  39.59 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  38.2 
 
 		 322 aa  190  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  37.9 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  39.13 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  40.43 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  38.3 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  40.46 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 383 aa  185  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  39.21 
 
 		 323 aa  185  9e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  38.8 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  38.8 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.54 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.08 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  38.32 
 
 		 321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  39.6 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  40.4 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  40.4 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  40.4 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  40.4 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  40.4 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  40.4 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  40.4 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  40.4 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  37.54 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  38.26 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  39.04 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  37.11 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  38.14 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  36.07 
 
 		 353 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  39.4 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  38.7 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 		 353 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  38.41 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  38.41 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  38.41 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  38.41 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  38.41 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  37.9 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  35.09 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.67 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.67 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  33.44 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  36.68 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>