More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1375 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1375  inner-membrane translocator  100 
 
 		 336 aa  624  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  61.34 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  63.34 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  61.16 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  61.16 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  61.16 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  61.16 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  61.16 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  61.16 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  61.16 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  55.76 
 
 		 335 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  38.21 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  38.85 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 		 311 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  38.54 
 
 		 311 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  39.53 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  38.54 
 
 		 311 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  39.53 
 
 		 334 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  38.22 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  38.22 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  38.22 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  35.96 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  38.59 
 
 		 317 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  38.1 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  37.67 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  36.83 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.24 
 
 		 336 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  40.4 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  35.56 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  38.62 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  38.86 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  36.99 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  38.31 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  40.77 
 
 		 327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.33 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  37.8 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  37.41 
 
 		 322 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  37.22 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.59 
 
 		 350 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 336 aa  169  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2442  monosaccharide-transporting ATPase  41.06 
 
 		 349 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  37 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  37.78 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 		 345 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 345 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 345 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  38.7 
 
 		 346 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6163  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000865468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  34.2 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  31.71 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  40.49 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  34.2 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  36.25 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  38.33 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  36.24 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0524  L-arabinose transporter permease protein  33.13 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299001  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7476  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.5 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0548  L-arabinose transporter permease protein  32.82 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0287231  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1181  L-arabinose transporter permease protein  34.73 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.62 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2762  L-arabinose transporter permease protein  32.82 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.84256  normal  0.399817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  38.14 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  33.43 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.63 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3705  L-arabinose transporter permease protein  32.82 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  38.08 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  37.01 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  38.07 
 
 		 325 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0140  L-arabinose transporter permease protein  32.82 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  35.47 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  35.54 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>