More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0114 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  100 
 
 
348 aa  674    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  86.21 
 
 
349 aa  588  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  64.6 
 
 
352 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  63.08 
 
 
352 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  63.55 
 
 
352 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  64.72 
 
 
353 aa  430  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  64.02 
 
 
352 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  58.86 
 
 
350 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  60.12 
 
 
353 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  61.85 
 
 
357 aa  384  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  59.15 
 
 
352 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  55.65 
 
 
355 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  53.29 
 
 
344 aa  344  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  53.55 
 
 
346 aa  332  5e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  54.46 
 
 
342 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  48.69 
 
 
347 aa  320  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  41.71 
 
 
377 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  41.81 
 
 
385 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  42.61 
 
 
340 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  38.98 
 
 
373 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  40.95 
 
 
344 aa  219  7e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  40.39 
 
 
376 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  38.59 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  39.4 
 
 
375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  39.4 
 
 
375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  37.9 
 
 
374 aa  212  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  41.55 
 
 
385 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.22 
 
 
385 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  38.59 
 
 
385 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  38.4 
 
 
373 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  38.16 
 
 
391 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  41.13 
 
 
374 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  41.13 
 
 
381 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  41.13 
 
 
381 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  41.13 
 
 
381 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  41.13 
 
 
381 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  41.13 
 
 
381 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  41.13 
 
 
381 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  39.44 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  40.92 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  38.87 
 
 
385 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  37.12 
 
 
373 aa  195  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  38.42 
 
 
373 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  34.71 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  39.8 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  33.54 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  28.27 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  31.27 
 
 
345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  31.27 
 
 
345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  29.25 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 
345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  29.25 
 
 
357 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  29.97 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.71 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  31.14 
 
 
345 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2601  monosaccharide-transporting ATPase  31.14 
 
 
324 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  30 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  31.12 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  29.75 
 
 
350 aa  113  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  27.81 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3057  inner-membrane translocator  32.17 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  30.91 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  32.05 
 
 
315 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  31.79 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  32.46 
 
 
333 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  31.27 
 
 
324 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  30.48 
 
 
324 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0549  inner-membrane translocator  31.99 
 
 
334 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  28.85 
 
 
333 aa  106  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  28.01 
 
 
339 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  26.61 
 
 
328 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  31.4 
 
 
355 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  30.38 
 
 
326 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  33.03 
 
 
334 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.38 
 
 
341 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  30.82 
 
 
336 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  28.69 
 
 
346 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  29.71 
 
 
335 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  27.78 
 
 
339 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2011  monosaccharide-transporting ATPase  26.54 
 
 
328 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  29.34 
 
 
317 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  31.45 
 
 
325 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  29.28 
 
 
350 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  29.84 
 
 
330 aa  103  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  29.84 
 
 
330 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  29.84 
 
 
330 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  28.2 
 
 
348 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  27.25 
 
 
358 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  31.7 
 
 
328 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1149  monosaccharide-transporting ATPase  31.29 
 
 
332 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  30.45 
 
 
345 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  27.73 
 
 
346 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  27.22 
 
 
326 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 
312 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  28.71 
 
 
319 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  28.89 
 
 
346 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  31.93 
 
 
354 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  28.57 
 
 
328 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  29 
 
 
341 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  27.9 
 
 
309 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>