More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1657 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
374 aa  739    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  100 
 
 
381 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  98.43 
 
 
381 aa  743    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  100 
 
 
381 aa  753    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  100 
 
 
381 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  100 
 
 
381 aa  753    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  100 
 
 
381 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  100 
 
 
381 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  82.6 
 
 
385 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  80.78 
 
 
385 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  81.3 
 
 
385 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  61.17 
 
 
385 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  54.12 
 
 
373 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  53.78 
 
 
374 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  52.97 
 
 
406 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  52.29 
 
 
373 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  52.03 
 
 
373 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  53.12 
 
 
376 aa  343  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  52.43 
 
 
375 aa  342  5.999999999999999e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  52.16 
 
 
375 aa  338  9e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  50.14 
 
 
340 aa  325  9e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  53.07 
 
 
373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  50.68 
 
 
391 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  51.25 
 
 
385 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  49.31 
 
 
344 aa  308  9e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  48.84 
 
 
344 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  43.37 
 
 
344 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  40.72 
 
 
347 aa  245  9e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  43.53 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  39.02 
 
 
349 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  41.13 
 
 
348 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  36.7 
 
 
352 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  42.34 
 
 
342 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  39.68 
 
 
377 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  37.78 
 
 
352 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  37.7 
 
 
352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  36.66 
 
 
352 aa  210  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  35.54 
 
 
352 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  36.63 
 
 
353 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  38.29 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  35.15 
 
 
355 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  40 
 
 
353 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  36.78 
 
 
357 aa  169  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  31.73 
 
 
328 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  30.1 
 
 
346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 
346 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.92 
 
 
350 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  30.4 
 
 
326 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  34.18 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  31.25 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  28.39 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  28.39 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  30.93 
 
 
339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  30.79 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 
363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  28.14 
 
 
394 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0905  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.52 
 
 
400 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  28.42 
 
 
345 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  28.91 
 
 
353 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  28.42 
 
 
345 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  28.15 
 
 
345 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  28.65 
 
 
353 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  29.03 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.44 
 
 
358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  28.66 
 
 
341 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4108  monosaccharide-transporting ATPase  29.33 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000328051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  28.34 
 
 
345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  32.58 
 
 
317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  30.9 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4262  monosaccharide-transporting ATPase  30.94 
 
 
336 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638371  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  28.84 
 
 
345 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.07 
 
 
345 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  29.89 
 
 
354 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  29.26 
 
 
394 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  29.92 
 
 
393 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 
342 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  29.47 
 
 
393 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  29 
 
 
334 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  29 
 
 
342 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  28.22 
 
 
347 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3040  inner-membrane translocator  26.22 
 
 
381 aa  124  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  28.37 
 
 
376 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4065  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  33.12 
 
 
330 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.937045  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0479  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  33.12 
 
 
330 aa  123  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0714563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0151  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  33.12 
 
 
330 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.302956  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 
311 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  30.58 
 
 
309 aa  123  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  30.6 
 
 
324 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  29.35 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  31.79 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  27.27 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  30.37 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  31.63 
 
 
336 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3763  Monosaccharide-transporting ATPase  32.56 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  29.37 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  31.46 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4484  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  32.56 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  28.65 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3173  inner-membrane translocator  30.59 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.536368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04099  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.56 
 
 
331 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>