More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0831 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  100 
 
 		 349 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  86.21 
 
 		 348 aa  588  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  67.07 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  63.71 
 
 		 353 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  63.53 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  62.2 
 
 		 352 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  63.1 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  59.65 
 
 		 350 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  61.93 
 
 		 353 aa  398  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  58.53 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  63.38 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  58.6 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  54.46 
 
 		 344 aa  346  4e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  53.27 
 
 		 346 aa  339  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  51.18 
 
 		 347 aa  332  6e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  54.79 
 
 		 342 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  41.87 
 
 		 377 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  37.7 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  41.05 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 340 aa  212  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 		 375 aa  212  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  39.56 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  41.55 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  39.02 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  38.75 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  39.02 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  39.02 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  39.02 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  39.02 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  39.02 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  39.02 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  38.74 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  39.04 
 
 		 391 aa  206  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 406 aa  206  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  38.54 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.02 
 
 		 385 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  37.7 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  40.34 
 
 		 373 aa  199  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  39.37 
 
 		 344 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  40 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  35.21 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.83 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  30.15 
 
 		 341 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  29.13 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  29.26 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  28.98 
 
 		 345 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  30.22 
 
 		 357 aa  119  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2011  monosaccharide-transporting ATPase  30.25 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  31.49 
 
 		 348 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2601  monosaccharide-transporting ATPase  31.91 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  28.95 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  30.77 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  29.02 
 
 		 347 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  29.23 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.67 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  31.66 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5242  monosaccharide-transporting ATPase  32.59 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  29.65 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  29.68 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  32.58 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  31.88 
 
 		 326 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  30.13 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  32.83 
 
 		 348 aa  102  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  29.09 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  29.36 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1149  monosaccharide-transporting ATPase  31.49 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0077  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  28.14 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0344  monosaccharide-transporting ATPase  29.6 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.324095  normal  0.0533702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  29.94 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  29.31 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5596  monosaccharide-transporting ATPase  30.54 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  28.97 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  27.63 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0235  monosaccharide-transporting ATPase  27.84 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.802766 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 334 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  30.87 
 
 		 322 aa  99.4  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 324 aa  99.4  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 324 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3278  monosaccharide-transporting ATPase  28.9 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.990654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 		 311 aa  99.4  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 342 aa  99.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  31.25 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3057  inner-membrane translocator  27.71 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.382796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>