More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0155 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  100 
 
 
324 aa  624  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  95.68 
 
 
324 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  79.75 
 
 
324 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  41.48 
 
 
315 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  41.78 
 
 
333 aa  209  4e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  39.61 
 
 
317 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  39.8 
 
 
310 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  36.18 
 
 
346 aa  206  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42 
 
 
336 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  44.33 
 
 
363 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  41.61 
 
 
315 aa  200  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  37.2 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  37.2 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  37.2 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  40.27 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  35.98 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  42.66 
 
 
327 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  41.42 
 
 
325 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  36.54 
 
 
318 aa  196  6e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.6 
 
 
345 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  38.37 
 
 
341 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  40.26 
 
 
345 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  37.67 
 
 
312 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  41.69 
 
 
336 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  36.28 
 
 
343 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  40.33 
 
 
333 aa  192  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  39.6 
 
 
345 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  39.27 
 
 
345 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  39.27 
 
 
345 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  39.27 
 
 
345 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  37.79 
 
 
343 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  41.02 
 
 
317 aa  190  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  41.02 
 
 
317 aa  190  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36 
 
 
350 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  40.58 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  40.58 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  38.65 
 
 
343 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40.58 
 
 
311 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  37.71 
 
 
331 aa  189  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  39.53 
 
 
327 aa  188  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6473  inner-membrane translocator  39.08 
 
 
343 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6708  inner-membrane translocator  39.08 
 
 
343 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46964  normal  0.292611 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  38.2 
 
 
327 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  38.6 
 
 
336 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  38.21 
 
 
320 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 
311 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 
311 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  39.86 
 
 
322 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  39.46 
 
 
314 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40.58 
 
 
311 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  35.92 
 
 
324 aa  186  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.6 
 
 
309 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 
311 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6314  monosaccharide-transporting ATPase  38.77 
 
 
343 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.359966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 
311 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40.26 
 
 
311 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.99 
 
 
330 aa  186  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 
330 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.99 
 
 
330 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  38.26 
 
 
342 aa  185  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  38.26 
 
 
342 aa  185  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  38.26 
 
 
342 aa  185  9e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  38.7 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  36.63 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  40.26 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  35.59 
 
 
345 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
339 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  38.24 
 
 
341 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  39.87 
 
 
318 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  40.14 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.84 
 
 
310 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  38.8 
 
 
347 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
322 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  36.84 
 
 
310 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  38.19 
 
 
322 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  39.18 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2687  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  37.04 
 
 
327 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  36.59 
 
 
355 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  36.49 
 
 
324 aa  179  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  34.65 
 
 
334 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  39.02 
 
 
322 aa  178  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.31 
 
 
835 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  38.34 
 
 
342 aa  178  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
328 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  38.91 
 
 
365 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  38.85 
 
 
320 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  36.31 
 
 
349 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1227  inner-membrane translocator  39.14 
 
 
349 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  37.85 
 
 
349 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  38.44 
 
 
322 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  37.41 
 
 
323 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  38.73 
 
 
314 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  37.38 
 
 
324 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  38.18 
 
 
334 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  34.34 
 
 
323 aa  175  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  38.96 
 
 
343 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.43 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>