More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4053 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  100 
 
 		 353 aa  681    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  63.71 
 
 		 349 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  70.3 
 
 		 353 aa  448  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  64.72 
 
 		 348 aa  444  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  65.88 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  63.22 
 
 		 350 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  64.88 
 
 		 352 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  66.47 
 
 		 352 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  64.29 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  66.87 
 
 		 357 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  59.66 
 
 		 352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  58.41 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  58.46 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  57.4 
 
 		 346 aa  363  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  52.24 
 
 		 347 aa  338  9e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  56.42 
 
 		 342 aa  333  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  39.36 
 
 		 385 aa  241  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  41.44 
 
 		 376 aa  239  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  41.78 
 
 		 377 aa  238  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 373 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  43.09 
 
 		 391 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  42.02 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  42.02 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  41.29 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  42.22 
 
 		 344 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  39.5 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  44.04 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 406 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  37.23 
 
 		 374 aa  209  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 373 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  37.23 
 
 		 385 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  36.1 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.9 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  36.83 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  36.63 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  36.63 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  36.63 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  36.63 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  36.63 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  36.63 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  29.36 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  32.97 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  28.49 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1149  monosaccharide-transporting ATPase  31.61 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0549  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.43 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  29.94 
 
 		 335 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  30.09 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  28.69 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2601  monosaccharide-transporting ATPase  28.62 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  29.69 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  27.86 
 
 		 326 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  32.4 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  29.94 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  29.31 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3431  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0344  monosaccharide-transporting ATPase  30.97 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.324095  normal  0.0533702 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.14 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  28.86 
 
 		 332 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  29.39 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  28.12 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  28.99 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0845  Monosaccharide-transporting ATPase  32.4 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102065  normal  0.0278084 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  27.33 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  26.8 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  29.5 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  28.91 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  28.03 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  30.06 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  29.43 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  29.43 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  27.79 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.43 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  28.45 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  29.43 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  28.78 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  29.14 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  27.6 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  27.6 
 
 		 353 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 354 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0914  monosaccharide-transporting ATPase  30.45 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2011  monosaccharide-transporting ATPase  26.73 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2265  Monosaccharide-transporting ATPase  26.73 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31.27 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>