More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4036 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  100 
 
 		 342 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  80.77 
 
 		 344 aa  534  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  69.28 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  56.42 
 
 		 353 aa  354  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  54.46 
 
 		 348 aa  353  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  53.12 
 
 		 352 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  54.63 
 
 		 349 aa  351  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  52.52 
 
 		 352 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  52.52 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  52.82 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  53.43 
 
 		 352 aa  343  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  54.22 
 
 		 350 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  50.46 
 
 		 352 aa  325  6e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  52.45 
 
 		 353 aa  321  9.000000000000001e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  48.66 
 
 		 355 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  51.23 
 
 		 357 aa  305  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  44.51 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  46.73 
 
 		 340 aa  275  8e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  47.81 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  51.84 
 
 		 344 aa  272  7e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  45.76 
 
 		 373 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  46.26 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  45.73 
 
 		 376 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  45.98 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  46.28 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  43.66 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  43.37 
 
 		 391 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  40.56 
 
 		 374 aa  235  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  40.44 
 
 		 406 aa  235  9e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  44.48 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  43.06 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  43.06 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  43.06 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  43.06 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  43.06 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  43.06 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  43.06 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  43.5 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  41.94 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  42.78 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.27 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  40.22 
 
 		 385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  38.23 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  32.62 
 
 		 326 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4992  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  29.81 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1149  monosaccharide-transporting ATPase  30.45 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  32.01 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 353 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 		 346 aa  123  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  34.31 
 
 		 353 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.83 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2601  monosaccharide-transporting ATPase  30.35 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0549  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.63 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  28.7 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 319 aa  119  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  32.27 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  29.56 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  29.47 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  29.56 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  29.56 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  29.94 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  29.01 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  27.41 
 
 		 334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  28.85 
 
 		 341 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  29.81 
 
 		 357 aa  115  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.56 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0845  Monosaccharide-transporting ATPase  32.71 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102065  normal  0.0278084 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  30.48 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3431  inner-membrane translocator  32.1 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8211  monosaccharide-transporting ATPase  30.09 
 
 		 337 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2606  monosaccharide-transporting ATPase  31.12 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3622  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  26.27 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  29.46 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0914  monosaccharide-transporting ATPase  32.17 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  29.04 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  27.61 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 317 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  28.09 
 
 		 328 aa  109  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 329 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  26.81 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9126  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  33.21 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.364667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1867  monosaccharide-transporting ATPase  30.95 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  28.08 
 
 		 345 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>