More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0417 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
318 aa  618  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  48.89 
 
 
328 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  48.72 
 
 
332 aa  281  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  46.03 
 
 
337 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  47.1 
 
 
334 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  44.98 
 
 
330 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  42.24 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  44.55 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  47.4 
 
 
335 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  47.75 
 
 
335 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  44.76 
 
 
334 aa  238  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  41.85 
 
 
342 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  39.94 
 
 
317 aa  232  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  43.32 
 
 
338 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  43.32 
 
 
338 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.74 
 
 
338 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  40.79 
 
 
327 aa  215  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  43.37 
 
 
322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  38.16 
 
 
331 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  36.31 
 
 
337 aa  192  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  38.7 
 
 
329 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  35.85 
 
 
337 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  39.59 
 
 
320 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  34.55 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  34.93 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  37.85 
 
 
337 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  34.62 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 
311 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  34.93 
 
 
328 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 
311 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  34.44 
 
 
336 aa  172  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  34.62 
 
 
328 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  34.62 
 
 
328 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.42 
 
 
311 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 
311 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  34.62 
 
 
328 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2474  L-arabinose transporter permease protein  34.94 
 
 
326 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.552924  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01867  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  34.62 
 
 
329 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  34.25 
 
 
349 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1744  Monosaccharide-transporting ATPase  34.62 
 
 
328 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629454  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  34.59 
 
 
349 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 
311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.09 
 
 
311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1995  L-arabinose transporter permease protein  34.62 
 
 
328 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00340389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  34.59 
 
 
349 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 
311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01856  hypothetical protein  34.62 
 
 
329 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1736  L-arabinose transporter permease protein  34.62 
 
 
328 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.612736  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  34.93 
 
 
328 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.09 
 
 
311 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.09 
 
 
311 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.77 
 
 
311 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2147  L-arabinose transporter permease protein  35.27 
 
 
328 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  36.86 
 
 
322 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
333 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2606  Monosaccharide-transporting ATPase  38.93 
 
 
334 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.331878  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.95 
 
 
311 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  35.37 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  36.01 
 
 
327 aa  165  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  35.78 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  36.01 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  34.97 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  31.44 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  35.41 
 
 
338 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  31.14 
 
 
333 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  35.41 
 
 
329 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  31.61 
 
 
345 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  31.14 
 
 
333 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  35.41 
 
 
338 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 
341 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  31.15 
 
 
334 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  34.5 
 
 
328 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 
329 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4139  L-arabinose transporter permease protein  33.01 
 
 
322 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.494868  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  34.02 
 
 
306 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  32.45 
 
 
311 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  37.07 
 
 
310 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2265  Monosaccharide-transporting ATPase  34.36 
 
 
328 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.7 
 
 
329 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  34.02 
 
 
334 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.56 
 
 
324 aa  160  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  31.87 
 
 
350 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.81 
 
 
346 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  34.2 
 
 
316 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.94 
 
 
345 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  34.7 
 
 
323 aa  159  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  32.64 
 
 
309 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.8 
 
 
309 aa  159  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  34.83 
 
 
322 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  35.46 
 
 
310 aa  158  9e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  30.99 
 
 
329 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 
312 aa  159  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  35.08 
 
 
338 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  35.96 
 
 
329 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 
346 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  31.76 
 
 
338 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  30.62 
 
 
345 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  29.97 
 
 
341 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  30.62 
 
 
345 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  31.65 
 
 
347 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>