More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B2265 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  100 
 
 
329 aa  641    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  93.62 
 
 
329 aa  588  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  93.01 
 
 
338 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  92.71 
 
 
338 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  93.01 
 
 
329 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  92.4 
 
 
338 aa  578  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  94.22 
 
 
329 aa  551  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3014  putative ribose ABC transporter, permease protein  94.55 
 
 
220 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.422083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2972  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  92.96 
 
 
215 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000021735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  44.92 
 
 
332 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  44.92 
 
 
332 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  44.92 
 
 
332 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  44.92 
 
 
332 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  44.62 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  42.64 
 
 
333 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  42.64 
 
 
333 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  42.33 
 
 
333 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  44.52 
 
 
327 aa  251  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1657  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  43.12 
 
 
330 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.924695 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2131  Monosaccharide-transporting ATPase  43.12 
 
 
330 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.441175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1597  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  43.12 
 
 
330 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2143  monosaccharide-transporting ATPase  43.12 
 
 
330 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2128  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  42.81 
 
 
330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3147  inner-membrane translocator  43.83 
 
 
327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.696622  normal  0.299191 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3501  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  43.51 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3534  inner-membrane translocator  43.34 
 
 
327 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0938671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  36.78 
 
 
337 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.38 
 
 
338 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01472  AI2 transporter  40.78 
 
 
265 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  35.35 
 
 
317 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  32.73 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  34.95 
 
 
338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  35.08 
 
 
318 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  32.37 
 
 
309 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.63 
 
 
338 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  34.81 
 
 
329 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.58 
 
 
312 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.87 
 
 
330 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 
330 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 
330 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  37.31 
 
 
310 aa  155  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  32.25 
 
 
333 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  35.77 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  34 
 
 
354 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  30.57 
 
 
314 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  31.43 
 
 
315 aa  149  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.95 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  32.47 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  32.47 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  32.47 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  35.09 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33.67 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  33.23 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  33.65 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
311 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.62 
 
 
311 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  31.1 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
311 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
311 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.62 
 
 
311 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 
311 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.62 
 
 
311 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.62 
 
 
311 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 
345 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  31.29 
 
 
334 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  34.67 
 
 
365 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  33.23 
 
 
350 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  30.34 
 
 
332 aa  143  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  30.22 
 
 
346 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  30.51 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  30.51 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  34.09 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  31.82 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  28.66 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.77 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  33.76 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
311 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.77 
 
 
310 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  31.76 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  32.38 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  30.65 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  31.69 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 
350 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  30.22 
 
 
346 aa  139  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  33.92 
 
 
322 aa  139  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  31.56 
 
 
405 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  32.28 
 
 
365 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  30.79 
 
 
355 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2716  high-affinity D-ribose ABC transporter membrane protein  32.71 
 
 
365 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139094  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  34.3 
 
 
333 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31.83 
 
 
322 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  32.06 
 
 
339 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  30.95 
 
 
334 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  30.95 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  30.33 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 
835 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.06 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>