More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2302 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  100 
 
 		 331 aa  630  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  56.97 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  54.15 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  51.17 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  49.65 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  50.65 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  50.53 
 
 		 338 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  50.53 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  45.66 
 
 		 337 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3701  inner-membrane translocator  44.55 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.314469 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  41.64 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  40.81 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  40.45 
 
 		 337 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 336 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  40.4 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  39.8 
 
 		 337 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  43.36 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  39.72 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  36.84 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  40.43 
 
 		 322 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  37.8 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  38.41 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  37.46 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  37.24 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  42.04 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  36.43 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  36.43 
 
 		 349 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  36.63 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  36.43 
 
 		 349 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01867  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  36.63 
 
 		 329 aa  159  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  36.63 
 
 		 328 aa  159  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1744  Monosaccharide-transporting ATPase  36.25 
 
 		 328 aa  158  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629454  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  36.63 
 
 		 328 aa  159  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1736  L-arabinose transporter permease protein  36.25 
 
 		 328 aa  158  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.612736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  36.63 
 
 		 328 aa  159  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01856  hypothetical protein  36.63 
 
 		 329 aa  159  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1995  L-arabinose transporter permease protein  36.25 
 
 		 328 aa  158  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00340389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  37.05 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1021  L-arabinose transporter permease protein  38.96 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.53 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  37.05 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  40.68 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  36.69 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2147  L-arabinose transporter permease protein  37.37 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.61 
 
 		 329 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  36.55 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.68 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  36.33 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  37.29 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  34.39 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  34.39 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2474  L-arabinose transporter permease protein  35.31 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.552924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  36.27 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  36.24 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  34.53 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  30.92 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  34.49 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.88 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32.88 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  33.83 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.88 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  34.38 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  30.47 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  30.47 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  30.47 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  30.47 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.6 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  34.59 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  30.11 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  33.33 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  35.61 
 
 		 329 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  32.67 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2606  Monosaccharide-transporting ATPase  43.62 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.331878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.6 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  29.7 
 
 		 333 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2687  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  29.7 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  30.61 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  29.37 
 
 		 333 aa  135  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  34.87 
 
 		 835 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>