More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2431 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  100 
 
 		 328 aa  636    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  83.74 
 
 		 330 aa  530  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  77.23 
 
 		 337 aa  487  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  76.78 
 
 		 332 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  76.92 
 
 		 334 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  77.96 
 
 		 335 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  77.96 
 
 		 335 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  66.56 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  51.82 
 
 		 327 aa  285  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  48.89 
 
 		 318 aa  277  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  52.78 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  40.61 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  38.99 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.32 
 
 		 338 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  38.39 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.84 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 317 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  40.19 
 
 		 337 aa  195  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  39.64 
 
 		 336 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  39.55 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  41.58 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.81 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  36.59 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  38.69 
 
 		 316 aa  169  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  38.49 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  39.86 
 
 		 335 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  36.36 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  38.43 
 
 		 333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.59 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  41.06 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  41.06 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  41.06 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  41.06 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.42 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  35.74 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.42 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  40.65 
 
 		 335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  38.82 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  33.14 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 		 334 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 		 334 aa  159  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  40.24 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2606  Monosaccharide-transporting ATPase  37.38 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.331878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  35.37 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 326 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  34.2 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  32.15 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02651  Ribose transport system permease protein rbsC  36.86 
 
 		 327 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  36 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3322  monosaccharide-transporting ATPase  36.49 
 
 		 327 aa  152  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.897327  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  36.57 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.04 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  33.95 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1227  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.69 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.04 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6473  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6314  monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.359966 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6708  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46964  normal  0.292611 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02612  hypothetical protein  38.49 
 
 		 276 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  32.28 
 
 		 332 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.69 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  32.28 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.69 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  32.28 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  32.28 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  32.28 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.08 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  31.69 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  32.79 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  36.14 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  33.93 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1666  Monosaccharide-transporting ATPase  36.78 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  31.99 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  33.85 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>