More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2209 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 327 aa  627  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  67.86 
 
 		 320 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  50.78 
 
 		 332 aa  308  9e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  50.95 
 
 		 328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  51.9 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  51.58 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  50.16 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  50.81 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  52.23 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  51.2 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  40.4 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  40.72 
 
 		 333 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.78 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  38.65 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  39.22 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  42.91 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  41.52 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 309 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  35.78 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  37.85 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.71 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  35.05 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  36.79 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  39.45 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  36.68 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 340 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.93 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  38.41 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  36.27 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  37.45 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  37.23 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  36.6 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  31.23 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  31.73 
 
 		 335 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  39.02 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  32.17 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  35.62 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  31.09 
 
 		 335 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  30.59 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  31.23 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  31.09 
 
 		 335 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  39.08 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 337 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  30.87 
 
 		 315 aa  148  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  38.74 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  38.74 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  32.43 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  32.43 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  38.74 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  38.74 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  39.07 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  32.13 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  34.8 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  34.32 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1196  ribose ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0858  carbohydrate ABC transporter permease  38.69 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1640  carbohydrate ABC transporter permease  38.69 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.367254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0302  carbohydrate ABC transporter permease  38.69 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0470774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2071  ribose ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 		 341 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117227  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  32.36 
 
 		 332 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 322 aa  145  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1909  carbohydrate ABC transporter permease  38.69 
 
 		 339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.071894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1922  carbohydrate ABC transporter permease  38.69 
 
 		 339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  32.36 
 
 		 332 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  32.36 
 
 		 332 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  32.36 
 
 		 332 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  32.36 
 
 		 332 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  29.45 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  31.05 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.05 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  34.34 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.55 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.27 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.08 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  32.04 
 
 		 327 aa  143  5e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  34.36 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3701  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 352 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.314469 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  35 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  34.33 
 
 		 357 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>