More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6269 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  100 
 
 		 337 aa  653    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  81.16 
 
 		 332 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  88.03 
 
 		 335 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  86.73 
 
 		 335 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  77.23 
 
 		 328 aa  487  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  74.38 
 
 		 330 aa  467  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  75.23 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  66.77 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  52.29 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  46.03 
 
 		 318 aa  263  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  50.51 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  39.02 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  42.12 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.69 
 
 		 338 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  39.06 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.63 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  38.54 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  40.45 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  42.65 
 
 		 322 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  39.3 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  35.01 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  41.6 
 
 		 329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  36.61 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  36.9 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.54 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  36.83 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  35.37 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  35.37 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  35.05 
 
 		 349 aa  155  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  34.14 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  34.72 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  40.24 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  40.24 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  40.24 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  32.93 
 
 		 348 aa  153  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  40.24 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  39.43 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2606  Monosaccharide-transporting ATPase  35.56 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.331878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  39.43 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  35.24 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  33.63 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  33.54 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  34.15 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  30.92 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.88 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  38.57 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 311 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.55 
 
 		 311 aa  149  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  31.33 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  37.55 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  34.52 
 
 		 327 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  36.1 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  31.94 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  31.94 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  31.94 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  31.94 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  33.69 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.22 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  31.61 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.22 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  33.75 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  34.06 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  33.68 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  34.95 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  36.16 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  35.79 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01867  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  35.79 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01856  hypothetical protein  35.79 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  35.79 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  35.79 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 339 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  35.79 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1744  Monosaccharide-transporting ATPase  35.79 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1736  L-arabinose transporter permease protein  35.79 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.612736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1995  L-arabinose transporter permease protein  35.79 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00340389  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  30.58 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>