More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3461 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 342 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  89.55 
 
 		 338 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  88.96 
 
 		 338 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  78.96 
 
 		 333 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  56.79 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  49.08 
 
 		 329 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  49.65 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  42.47 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  41.85 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  40.61 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  39.51 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  38.53 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  39.02 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3701  inner-membrane translocator  46.25 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.314469 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  41.35 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  46.44 
 
 		 341 aa  205  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  39.74 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  39.7 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  42.44 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  43.62 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  38.87 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 317 aa  193  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.26 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 335 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  39.09 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.06 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.06 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  38.43 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.2 
 
 		 312 aa  169  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  38.23 
 
 		 331 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 311 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  38.08 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  38.08 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  38.08 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.72 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  35.91 
 
 		 348 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  38.25 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  38.08 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  39.85 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  37.38 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  40 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 317 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  32.52 
 
 		 348 aa  162  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.93 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  38.93 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  35.49 
 
 		 317 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  36.49 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.72 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  34.36 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  34.02 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  34.02 
 
 		 333 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  31.5 
 
 		 329 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  33.68 
 
 		 333 aa  159  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  36.4 
 
 		 322 aa  159  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  33.13 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 835 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  36.15 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  37.54 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  34.58 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  40.21 
 
 		 324 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  34.16 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  34.16 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.76 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  35.29 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  37.76 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  31.19 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 		 329 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  34.52 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  32.83 
 
 		 338 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  33.13 
 
 		 338 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  33.23 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  34.37 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  31 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.7 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  35.44 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  33.33 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  30.7 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  38.28 
 
 		 348 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  30.7 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>