More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3567 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
332 aa  643    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  81.16 
 
 
337 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  83.66 
 
 
335 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  83.33 
 
 
335 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  76.78 
 
 
328 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  74.01 
 
 
330 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  72.14 
 
 
334 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  62.12 
 
 
334 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  51.63 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  48.72 
 
 
318 aa  271  8.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  52.41 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  38.53 
 
 
342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  41.53 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  40.07 
 
 
333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.78 
 
 
338 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  40.14 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  39.81 
 
 
331 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.06 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  36.33 
 
 
337 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  37.42 
 
 
317 aa  182  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  42.76 
 
 
322 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  39.56 
 
 
336 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  42.59 
 
 
329 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 
312 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  36.86 
 
 
336 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  37.3 
 
 
337 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  35.52 
 
 
337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.02 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.02 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  36.21 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.63 
 
 
309 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  34.2 
 
 
331 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  40.32 
 
 
337 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.97 
 
 
311 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.97 
 
 
311 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
333 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 
311 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.97 
 
 
311 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.64 
 
 
311 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  40.32 
 
 
337 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.97 
 
 
311 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  40.32 
 
 
337 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  40.32 
 
 
337 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
315 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 
311 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  40.32 
 
 
337 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  33.64 
 
 
341 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  33.94 
 
 
332 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  36.53 
 
 
306 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  39.52 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  35.33 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  35.33 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  33.33 
 
 
335 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  33.33 
 
 
335 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  35.02 
 
 
349 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  33.63 
 
 
327 aa  155  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  35.48 
 
 
322 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.98 
 
 
311 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  34.15 
 
 
333 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.97 
 
 
311 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 
348 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  37.18 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.49 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  39.18 
 
 
335 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  39.11 
 
 
337 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2606  Monosaccharide-transporting ATPase  35.28 
 
 
334 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.331878  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  33.11 
 
 
310 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  32.23 
 
 
331 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  32.65 
 
 
333 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  31.96 
 
 
320 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  33.23 
 
 
333 aa  150  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  32.43 
 
 
335 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  33.11 
 
 
310 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.84 
 
 
342 aa  150  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  34.93 
 
 
325 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  36.88 
 
 
341 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 
310 aa  149  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.64 
 
 
333 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
345 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  33.33 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  33.33 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.02 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  33.11 
 
 
835 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  33.33 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  33.33 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  33.33 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  30.29 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  34.3 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  33.33 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  33.98 
 
 
328 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  34.69 
 
 
336 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  31.4 
 
 
348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  38.34 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  30.99 
 
 
345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  36.23 
 
 
330 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
339 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>