More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3043 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 329 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  57.98 
 
 		 331 aa  299  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  53.01 
 
 		 333 aa  286  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  52.13 
 
 		 338 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  49.54 
 
 		 342 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  52.13 
 
 		 338 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  50 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  50.48 
 
 		 337 aa  261  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  53.75 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3701  inner-membrane translocator  53.09 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.314469 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  41.64 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  41.91 
 
 		 336 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  37.99 
 
 		 337 aa  188  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  38.85 
 
 		 332 aa  182  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  38.82 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  40.37 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  42.29 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  36.18 
 
 		 329 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  35.37 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  38.66 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 330 aa  172  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  35.37 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  35.05 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 		 329 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  43.57 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  41.99 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  35.53 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  39.51 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.27 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  36.51 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.36 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.36 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  40 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  32.84 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  32.84 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  32.54 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  39.52 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  37.98 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  40.54 
 
 		 320 aa  149  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  36.58 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  34.49 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.08 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  39.11 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  31.93 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  31.93 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  31.93 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  31.93 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  31.93 
 
 		 332 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 321 aa  145  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  37.59 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  37.05 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  31.95 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.9 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  36.36 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.05 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  34.6 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  36.07 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  31.63 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 345 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  32.78 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  34.44 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  35.87 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  34.09 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2606  Monosaccharide-transporting ATPase  39.63 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.331878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  35.34 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  33.69 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 346 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  36.6 
 
 		 347 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.56 
 
 		 324 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  33.1 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  36.05 
 
 		 314 aa  135  9e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  33 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  35.2 
 
 		 339 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2596  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  32.39 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  30.42 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.16 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  29.07 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.02 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  35.08 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  32.04 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  32.04 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  30.67 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  35.08 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  35.08 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>