More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6713 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  100 
 
 		 335 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  85.63 
 
 		 337 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  96.72 
 
 		 335 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  82.57 
 
 		 332 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  77.36 
 
 		 328 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  72.56 
 
 		 330 aa  460  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  73.68 
 
 		 334 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  62.88 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  51.66 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  47.35 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  41.88 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  40.75 
 
 		 333 aa  225  9e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  39.08 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  40.26 
 
 		 338 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.7 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  35.53 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 317 aa  185  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  40.12 
 
 		 336 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  37.34 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  35.63 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  34.23 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.99 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  39.52 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  39.52 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  39.52 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  39.52 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  40.42 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  31.82 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  39.92 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  31.82 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  35.94 
 
 		 332 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.55 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  34.02 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.31 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  36.42 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.99 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  36.09 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  34.85 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  34.85 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 		 311 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  34.55 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 311 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 311 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.66 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.66 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2606  Monosaccharide-transporting ATPase  35.56 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.331878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  39.11 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  32.64 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 326 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  31.64 
 
 		 348 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  34.69 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  35.23 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  32.64 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  34.04 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  33.84 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.36 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  35.36 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  33.55 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  34.56 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  34.4 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  33.33 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  32.69 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  32.53 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  31.16 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  32.36 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 		 835 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  32.36 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  34.26 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3322  monosaccharide-transporting ATPase  34.04 
 
 		 327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.897327  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  31.72 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  31.72 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  32.57 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  31.72 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  31.72 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  31.87 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  31.02 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>