More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0582 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 338 aa  671    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  40.27 
 
 		 318 aa  212  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  36.84 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  35.63 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  32.26 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  35.06 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  34.98 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  36.33 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  34.75 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.43 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  33.13 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  33.44 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 		 329 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  36.2 
 
 		 317 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  34.95 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  34.95 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  34.95 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  34.95 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  35.5 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 335 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  31.96 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  33.44 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  31.96 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  31.96 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  31.96 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  35.53 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  35.76 
 
 		 334 aa  166  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  32.78 
 
 		 359 aa  165  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  32.47 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 320 aa  163  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  34.4 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  34.46 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 311 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.33 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.33 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  35.47 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.67 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  34.85 
 
 		 322 aa  159  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  32.33 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  35.47 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  33.74 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  36.18 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  33.33 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  32.48 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  34.91 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2131  Monosaccharide-transporting ATPase  32.19 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.441175  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.15 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1597  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  32.19 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2143  monosaccharide-transporting ATPase  32.19 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1657  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  32.19 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.924695 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  34.39 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  31.6 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  35.09 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3501  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.92 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2128  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  32.19 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  35.09 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3147  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.696622  normal  0.299191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  31.6 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  34.72 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  31.7 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  31.7 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  34.59 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  31.18 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.23 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  33.23 
 
 		 329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  32.83 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  31.13 
 
 		 316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  34.42 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  35.9 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  33.94 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  33.94 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  33.94 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  32 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  33.94 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  33.94 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  34.77 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>