More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2131 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2131  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 330 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.441175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1597  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  100 
 
 		 330 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2128  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  99.39 
 
 		 330 aa  636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2143  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 330 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1657  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  99.7 
 
 		 330 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.924695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  83.9 
 
 		 332 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  83.59 
 
 		 332 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  83.9 
 
 		 332 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  83.9 
 
 		 332 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  83.9 
 
 		 332 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  80.31 
 
 		 333 aa  522  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  80.62 
 
 		 333 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  80.62 
 
 		 333 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01472  AI2 transporter  100 
 
 		 265 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  65.94 
 
 		 327 aa  419  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3534  inner-membrane translocator  69.85 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0938671 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3147  inner-membrane translocator  55.45 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.696622  normal  0.299191 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3501  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  55.14 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  42.51 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  42.64 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  43.12 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  42.64 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  42.64 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  42.64 
 
 		 338 aa  248  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  42.81 
 
 		 329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1715  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD, truncation  100 
 
 		 114 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  39.5 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.19 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3014  putative ribose ABC transporter, permease protein  42.13 
 
 		 220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.422083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2972  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  42.13 
 
 		 215 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000021735 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  34.45 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  37.17 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 318 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.06 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  34.65 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  31.58 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  33.11 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 309 aa  146  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.68 
 
 		 330 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.68 
 
 		 330 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.68 
 
 		 330 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  34.29 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.57 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  34.08 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  34.16 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.5 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  32.81 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.24 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.24 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  32.07 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.24 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.36 
 
 		 311 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.02 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.68 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.68 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  30.7 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.58 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  31.44 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  36.71 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 383 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  32.11 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  34.47 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  31.06 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  31.06 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 365 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  31.06 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  33.82 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 335 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  33.86 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  34.3 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  32.45 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.12 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  32.13 
 
 		 360 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  32.45 
 
 		 347 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  30.63 
 
 		 317 aa  126  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  31.09 
 
 		 318 aa  126  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  31.09 
 
 		 318 aa  126  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  31.09 
 
 		 318 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>