More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3014 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3014  putative ribose ABC transporter, permease protein  100 
 
 
220 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.422083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  97.27 
 
 
329 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  96.82 
 
 
338 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  94.55 
 
 
329 aa  397  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  96.36 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  96.36 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  96.36 
 
 
329 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2972  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  96.26 
 
 
215 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000021735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  95 
 
 
329 aa  358  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  44.09 
 
 
332 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  44.09 
 
 
332 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  44.09 
 
 
332 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  44.09 
 
 
332 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  43.64 
 
 
332 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  45.75 
 
 
327 aa  178  5.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  42.27 
 
 
333 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  42.27 
 
 
333 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  42.27 
 
 
333 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01472  AI2 transporter  42.13 
 
 
265 aa  170  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2131  Monosaccharide-transporting ATPase  42.13 
 
 
330 aa  170  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.441175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1597  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  42.13 
 
 
330 aa  170  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2143  monosaccharide-transporting ATPase  42.13 
 
 
330 aa  170  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1657  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  42.13 
 
 
330 aa  170  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.924695 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2128  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  41.67 
 
 
330 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3501  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  46 
 
 
327 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3147  inner-membrane translocator  45.5 
 
 
327 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.696622  normal  0.299191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3534  inner-membrane translocator  43.63 
 
 
327 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0938671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  34.68 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  35.12 
 
 
310 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  33.67 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  32.32 
 
 
835 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.53 
 
 
350 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.23 
 
 
338 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  29.65 
 
 
309 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2030  inner-membrane translocator  34.12 
 
 
356 aa  111  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  35.38 
 
 
329 aa  111  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  35.53 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  38.79 
 
 
324 aa  109  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  33.89 
 
 
365 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  32.39 
 
 
365 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.34 
 
 
312 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  31.02 
 
 
345 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  31.34 
 
 
333 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  35.23 
 
 
333 aa  105  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  30.88 
 
 
333 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  31.03 
 
 
329 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  31.55 
 
 
334 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  32.84 
 
 
350 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  30.58 
 
 
346 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  31.31 
 
 
321 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  31.13 
 
 
342 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  33.54 
 
 
336 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  31.71 
 
 
310 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  31.71 
 
 
310 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3250  ribose ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 
381 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.16 
 
 
330 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.16 
 
 
330 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  32.38 
 
 
332 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32.16 
 
 
330 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  33.67 
 
 
318 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  33.49 
 
 
345 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  34.67 
 
 
317 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  32.21 
 
 
332 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  30.22 
 
 
317 aa  102  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  30.22 
 
 
317 aa  102  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  31.58 
 
 
331 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  30.1 
 
 
346 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3384  monosaccharide-transporting ATPase  35 
 
 
381 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0912  ribose ABC transporter permease  35 
 
 
381 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2716  high-affinity D-ribose ABC transporter membrane protein  30.85 
 
 
365 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139094  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  32.5 
 
 
336 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6207  inner-membrane translocator  30 
 
 
341 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.729739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1965  inner-membrane translocator  30 
 
 
341 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.389843  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  36.5 
 
 
328 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  32.66 
 
 
327 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31.31 
 
 
322 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.54 
 
 
345 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  33.16 
 
 
322 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  34.52 
 
 
332 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  36.23 
 
 
330 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  30.65 
 
 
342 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  31.31 
 
 
322 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  32.54 
 
 
345 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  32.54 
 
 
345 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  32.54 
 
 
345 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  32.54 
 
 
345 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  30.41 
 
 
314 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  31.28 
 
 
334 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  30.65 
 
 
342 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  34.67 
 
 
317 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  34.67 
 
 
317 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  33.16 
 
 
348 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.47 
 
 
311 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33 
 
 
347 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  34.83 
 
 
328 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  35.68 
 
 
317 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  32.51 
 
 
339 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  31.09 
 
 
332 aa  99.4  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32 
 
 
336 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  32 
 
 
336 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>