More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3735 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 336 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  100 
 
 		 336 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  97.32 
 
 		 336 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  68.31 
 
 		 332 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  65.97 
 
 		 335 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  48.05 
 
 		 334 aa  249  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1335  inner-membrane translocator  41.3 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0781195  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  35.76 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4064  monosaccharide-transporting ATPase  43.77 
 
 		 329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1271  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.36 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.123363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  38.26 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3822  monosaccharide-transporting ATPase  41.14 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4656  monosaccharide-transporting ATPase  41.03 
 
 		 339 aa  189  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4326  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1402  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0354839  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4372  inner-membrane translocator  40.71 
 
 		 341 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3317  inner-membrane translocator  41.82 
 
 		 364 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5193  Monosaccharide-transporting ATPase  41.67 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  40.4 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  40.4 
 
 		 317 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  40.4 
 
 		 317 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3268  carbohydrate ABC transporter permease  34.97 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3401  monosaccharide-transporting ATPase  34.97 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3721  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  39.39 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0783  monosaccharide-transporting ATPase  38.82 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2411  monosaccharide-transporting ATPase  39.53 
 
 		 359 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2310  carbohydrate ABC transporter permease  39.53 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4618  inner-membrane translocator  39.55 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921966 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5313  inner-membrane translocator  39.12 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3636  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.85 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  31.93 
 
 		 333 aa  142  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.52 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3562  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  31.1 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  31.35 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  31.64 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  31.35 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  31.35 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  31.35 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.77 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.77 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.25 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.25 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.98 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.01 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.25 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  31.83 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  31.83 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.66 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 350 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 343 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 343 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  30.09 
 
 		 329 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.33 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  34.19 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.33 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  34.19 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  29.61 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  33.03 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  32.9 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  33.88 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.49 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  31.56 
 
 		 333 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  35.47 
 
 		 355 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  31.94 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  31.94 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  29.88 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  32.8 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.85 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31.92 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  30.03 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>