More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3562 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3562  inner-membrane translocator  100 
 
 
350 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3636  inner-membrane translocator  64.65 
 
 
332 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66011  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4618  inner-membrane translocator  62.95 
 
 
328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.921966 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5313  inner-membrane translocator  63.28 
 
 
328 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3268  carbohydrate ABC transporter permease  43.32 
 
 
345 aa  255  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3401  monosaccharide-transporting ATPase  43.31 
 
 
346 aa  255  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0783  monosaccharide-transporting ATPase  46.23 
 
 
345 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3721  inner-membrane translocator  42.82 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 
318 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 
318 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  41 
 
 
318 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  42.24 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  42.24 
 
 
317 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  42.24 
 
 
317 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  42.9 
 
 
317 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  36.36 
 
 
316 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  37.66 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  37 
 
 
335 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  34.84 
 
 
332 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.64 
 
 
336 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  35.64 
 
 
336 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3822  monosaccharide-transporting ATPase  34.04 
 
 
328 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  34.98 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4656  monosaccharide-transporting ATPase  31.56 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4064  monosaccharide-transporting ATPase  32.85 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  31.33 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1335  inner-membrane translocator  31.56 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0781195  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1271  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.54 
 
 
342 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.123363 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  32.52 
 
 
309 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.12 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.93 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.93 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32.93 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  30.54 
 
 
309 aa  119  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1402  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.65 
 
 
348 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0354839  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5193  Monosaccharide-transporting ATPase  30.94 
 
 
352 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  29.28 
 
 
315 aa  116  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  28.57 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3317  inner-membrane translocator  33.57 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  28.12 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  28.43 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  29.47 
 
 
346 aa  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  28.43 
 
 
335 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4326  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
357 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  28.62 
 
 
332 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  31.65 
 
 
342 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  31.02 
 
 
333 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1273  inner-membrane translocator  32.96 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  32.06 
 
 
328 aa  109  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  31.3 
 
 
349 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  31.3 
 
 
327 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  31.3 
 
 
349 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  31.3 
 
 
349 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  30.72 
 
 
324 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  25.71 
 
 
314 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 
341 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  29.18 
 
 
336 aa  106  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  32.44 
 
 
328 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  32.44 
 
 
328 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  29.93 
 
 
321 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0123  inner-membrane translocator  31.86 
 
 
343 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0548  L-arabinose transporter permease protein  29.39 
 
 
338 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0318738  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  35.03 
 
 
343 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  30.49 
 
 
345 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3409  L-arabinose transporter permease protein  28.72 
 
 
338 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0925142  normal  0.0828764 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0591  L-arabinose transporter permease protein  28.81 
 
 
338 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal  0.0412649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0140  L-arabinose transporter permease protein  28.81 
 
 
338 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  30.49 
 
 
345 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0623  L-arabinose transporter permease protein  28.81 
 
 
338 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000899793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  30.49 
 
 
345 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  30.66 
 
 
322 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  30.28 
 
 
347 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  29.49 
 
 
337 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  30.28 
 
 
345 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3446  L-arabinose transporter permease protein  28.82 
 
 
334 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2484  L-arabinose transporter permease protein  28.82 
 
 
334 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3482  L-arabinose transporter permease protein  28.82 
 
 
334 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0404  L-arabinose transporter permease protein  28.82 
 
 
334 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.15645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1264  L-arabinose transporter permease protein  28.82 
 
 
334 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3484  L-arabinose transporter permease protein  28.82 
 
 
334 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3301  L-arabinose transporter permease protein  28.82 
 
 
334 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4372  inner-membrane translocator  28.39 
 
 
341 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  30.74 
 
 
322 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  31.45 
 
 
339 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  32.99 
 
 
341 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3705  L-arabinose transporter permease protein  28.47 
 
 
338 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.18 
 
 
345 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4266  monosaccharide-transporting ATPase  33.16 
 
 
341 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.525278  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  26.14 
 
 
332 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  30.87 
 
 
348 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  28.72 
 
 
349 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  25.82 
 
 
332 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  25.82 
 
 
332 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  25.82 
 
 
332 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  26.17 
 
 
324 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  25.82 
 
 
332 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  31.63 
 
 
326 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  30.92 
 
 
328 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1181  L-arabinose transporter permease protein  28.82 
 
 
334 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  27.5 
 
 
343 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>