More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4618 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4618  inner-membrane translocator  100 
 
 
328 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.921966 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5313  inner-membrane translocator  94.51 
 
 
328 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3636  inner-membrane translocator  79.19 
 
 
332 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66011  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3562  inner-membrane translocator  62.95 
 
 
350 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3268  carbohydrate ABC transporter permease  45.03 
 
 
345 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3401  monosaccharide-transporting ATPase  45.03 
 
 
346 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3721  inner-membrane translocator  44.94 
 
 
348 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0783  monosaccharide-transporting ATPase  44.82 
 
 
345 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  40.2 
 
 
318 aa  209  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  40.2 
 
 
318 aa  209  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  40.2 
 
 
318 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  44.07 
 
 
317 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  38.46 
 
 
316 aa  203  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  43.34 
 
 
317 aa  202  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  43.34 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  43.34 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
332 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  37.95 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  38.03 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3822  monosaccharide-transporting ATPase  36.24 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.55 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  39.55 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  39.55 
 
 
336 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1335  inner-membrane translocator  34.45 
 
 
353 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0781195  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1271  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.51 
 
 
342 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.123363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4656  monosaccharide-transporting ATPase  35.02 
 
 
339 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3317  inner-membrane translocator  37.29 
 
 
364 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4064  monosaccharide-transporting ATPase  36.92 
 
 
329 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5193  Monosaccharide-transporting ATPase  35.51 
 
 
352 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1402  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.33 
 
 
348 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0354839  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33 
 
 
312 aa  139  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  32.28 
 
 
309 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  32.59 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  30.48 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  29.51 
 
 
314 aa  129  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.57 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32.57 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  29.87 
 
 
332 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  30.61 
 
 
306 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 
311 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  30.62 
 
 
311 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 
311 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 
311 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4326  inner-membrane translocator  32.89 
 
 
357 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  29.97 
 
 
334 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  29.97 
 
 
342 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  31.51 
 
 
311 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  31.51 
 
 
311 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 
342 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  31.67 
 
 
327 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  28.75 
 
 
342 aa  123  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 
311 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 
311 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  31.19 
 
 
311 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  30.87 
 
 
311 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  31.37 
 
 
336 aa  122  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  28.57 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  30.62 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  32.13 
 
 
345 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  32.13 
 
 
345 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  32.46 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  32.48 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  32.13 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  32.13 
 
 
345 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 
310 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  31.38 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.48 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  30.26 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  29.45 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  31.63 
 
 
341 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  27.43 
 
 
331 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  28.97 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  28.97 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  30.97 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  28.97 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  28.97 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  33.66 
 
 
337 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  33.66 
 
 
337 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  33 
 
 
335 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
337 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
337 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  28.97 
 
 
332 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  33.66 
 
 
337 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.29 
 
 
333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  30.77 
 
 
334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  32.52 
 
 
341 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  28.57 
 
 
333 aa  115  8.999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
326 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  33 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3252  inner-membrane translocator  29.84 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0683493  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  32.62 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  27.1 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  26.95 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  32.33 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  28.52 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  27.1 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  29.45 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>