More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3317 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3317  inner-membrane translocator  100 
 
 		 364 aa  696    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  40.88 
 
 		 334 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  42.52 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  40.95 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1335  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 353 aa  195  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0781195  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4064  monosaccharide-transporting ATPase  42.42 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.82 
 
 		 336 aa  189  9e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  41.82 
 
 		 336 aa  189  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  41.64 
 
 		 336 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3822  monosaccharide-transporting ATPase  40.13 
 
 		 328 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  34.6 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3268  carbohydrate ABC transporter permease  35.56 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3401  monosaccharide-transporting ATPase  35.56 
 
 		 346 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  38.52 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3721  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  38.52 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  38.52 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1271  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.123363 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4372  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82281  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4656  monosaccharide-transporting ATPase  36.22 
 
 		 339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0783  monosaccharide-transporting ATPase  36.42 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  36.79 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  36.79 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  36.79 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4326  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 357 aa  156  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1402  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.81 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0354839  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  34.85 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5193  Monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4618  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 328 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  37.63 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5313  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3636  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  34.07 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2310  carbohydrate ABC transporter permease  36.78 
 
 		 353 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2411  monosaccharide-transporting ATPase  36.78 
 
 		 359 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.13 
 
 		 312 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  32.13 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  30.4 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  31.9 
 
 		 338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.03 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  31.6 
 
 		 338 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  31.6 
 
 		 329 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.64 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.64 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.92 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.92 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  30.49 
 
 		 329 aa  132  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.92 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.92 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  31.9 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  30.98 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4182  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3854  Monosaccharide-transporting ATPase  33.77 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.58 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.24 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  32.8 
 
 		 341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  30.88 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  33 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.01 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.01 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.37 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0344  monosaccharide-transporting ATPase  34.09 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.324095  normal  0.0533702 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  31.65 
 
 		 309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  32.07 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  32.51 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3252  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0683493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 345 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  30.06 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 345 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  33.81 
 
 		 333 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  34.27 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0249  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1682  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0233719  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  33.56 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.27 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>