More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4064 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4064  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 329 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1335  inner-membrane translocator  67.8 
 
 		 353 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0781195  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3822  monosaccharide-transporting ATPase  65.55 
 
 		 328 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4326  inner-membrane translocator  63.02 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1271  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  55 
 
 		 342 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.123363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4656  monosaccharide-transporting ATPase  54.33 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2411  monosaccharide-transporting ATPase  58.47 
 
 		 359 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2310  carbohydrate ABC transporter permease  58.47 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1402  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  55.33 
 
 		 348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0354839  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4372  inner-membrane translocator  52.78 
 
 		 341 aa  309  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82281  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5193  Monosaccharide-transporting ATPase  55 
 
 		 352 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  40.89 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  43.69 
 
 		 334 aa  212  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  43.34 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  43.34 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  42.66 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3317  inner-membrane translocator  40.74 
 
 		 364 aa  176  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  37.74 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  39.72 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  38.68 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  39.72 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  38.68 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  38.68 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  39.53 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3721  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3636  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0783  monosaccharide-transporting ATPase  33.97 
 
 		 345 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4618  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 328 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921966 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5313  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3401  monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3268  carbohydrate ABC transporter permease  33.45 
 
 		 345 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  35.79 
 
 		 343 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3562  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  31.72 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  31.72 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1682  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0233719  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.22 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  33.91 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2928  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110864  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.87 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  34.27 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.87 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  33.92 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.08 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  32.87 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3311  monosaccharide-transporting ATPase  34.76 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  32.87 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  32.88 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.44 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 329 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  32.64 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  35.42 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  31.21 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.27 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4182  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  33.57 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  32.74 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0055  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3854  Monosaccharide-transporting ATPase  31.85 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  34.02 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  32.99 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2822  monosaccharide-transporting ATPase  33 
 
 		 338 aa  116  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4266  monosaccharide-transporting ATPase  31.39 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.525278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  31.96 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  31.96 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  31.96 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  31.96 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  31.96 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  31.96 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  31.96 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  31.96 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  30.43 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  30.13 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0123  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  30.7 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  31.65 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  32.14 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.03 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1243  sugar transmembrane ABC transporter protein  33.44 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4139  L-arabinose transporter permease protein  32.38 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.494868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  31.44 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 333 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>