More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0783 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0783  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 345 aa  657    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3721  inner-membrane translocator  45.27 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3268  carbohydrate ABC transporter permease  42.99 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3401  monosaccharide-transporting ATPase  42.99 
 
 		 346 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3562  inner-membrane translocator  44.67 
 
 		 350 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  44.98 
 
 		 318 aa  236  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  44.66 
 
 		 318 aa  235  9e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  44.66 
 
 		 318 aa  235  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  40.94 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  45.82 
 
 		 317 aa  226  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  45.82 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  45.82 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3636  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  45.9 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4618  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921966 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5313  inner-membrane translocator  43.42 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  37.62 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  35.69 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.29 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  36.54 
 
 		 336 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1335  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0781195  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4656  monosaccharide-transporting ATPase  36.27 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3317  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3822  monosaccharide-transporting ATPase  34.67 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1271  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.21 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.123363 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4064  monosaccharide-transporting ATPase  34.62 
 
 		 329 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4372  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82281  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  31.75 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  31.51 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5193  Monosaccharide-transporting ATPase  35.52 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4326  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1402  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.17 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0354839  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  30.63 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.66 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.01 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.01 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.01 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  31.77 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  30.6 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  31.15 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  28.39 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  32.68 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.87 
 
 		 336 aa  122  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  29.34 
 
 		 328 aa  122  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01867  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  29.34 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1744  Monosaccharide-transporting ATPase  29.34 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  29.34 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01856  hypothetical protein  29.34 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  29.34 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1995  L-arabinose transporter permease protein  29.34 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00340389  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  29.34 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1736  L-arabinose transporter permease protein  29.34 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.612736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  30.53 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  30.82 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  30.41 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  30.18 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  30.34 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  30.34 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  30.18 
 
 		 342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  30.18 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 317 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2310  carbohydrate ABC transporter permease  32.92 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2411  monosaccharide-transporting ATPase  32.92 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8211  monosaccharide-transporting ATPase  31.56 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  29.3 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  29.7 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  28.84 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  28.8 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 316 aa  116  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  28.48 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  28.48 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  31.29 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3147  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.696622  normal  0.299191 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3501  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.54 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  31.65 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  28.94 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  27.24 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  29.41 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7476  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29.75 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  29.41 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2602  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>