More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3401 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3268  carbohydrate ABC transporter permease  99.71 
 
 		 345 aa  668    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3401  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 346 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3721  inner-membrane translocator  60.24 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0783  monosaccharide-transporting ATPase  43.65 
 
 		 345 aa  269  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3562  inner-membrane translocator  43.31 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  42.77 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3636  inner-membrane translocator  48.46 
 
 		 332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  46.08 
 
 		 317 aa  235  7e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  46.08 
 
 		 317 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  46.08 
 
 		 317 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  44.97 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4618  inner-membrane translocator  44.72 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921966 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  44.97 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  44.97 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5313  inner-membrane translocator  45.48 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  43.3 
 
 		 317 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  39.36 
 
 		 334 aa  196  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  35.28 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.31 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  35.38 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3317  inner-membrane translocator  36.19 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1271  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.01 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.123363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4656  monosaccharide-transporting ATPase  35.96 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5193  Monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1402  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.62 
 
 		 348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0354839  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4064  monosaccharide-transporting ATPase  34.44 
 
 		 329 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1335  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0781195  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3822  monosaccharide-transporting ATPase  31.96 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  30 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  30 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  29.27 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4372  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  28.35 
 
 		 334 aa  123  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 		 342 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  28.04 
 
 		 342 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  28.18 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  28.18 
 
 		 343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  29.3 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  30.34 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  30.34 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4326  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  29.94 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  29.94 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  29.53 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  30.25 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  29.94 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  29.94 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  29.94 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  29.94 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  28.38 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  28.38 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  28.38 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  29.63 
 
 		 311 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 331 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  28.3 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  27.36 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  29.43 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  26.28 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0123  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  29.32 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  29.32 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2479  ABC transporter related  39.13 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0564449  normal  0.0314231 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  30 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  32.19 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  27.89 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3252  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0683493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2602  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355907  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  33.5 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  28.12 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  26.97 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  29.47 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  29.47 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  28.79 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3057  inner-membrane translocator  27.41 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  25.4 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  27.64 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  29.55 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  26.73 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  28.57 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  29.26 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  28.78 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  29.55 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>