More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2442 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  100 
 
 		 348 aa  671    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3252  inner-membrane translocator  66.36 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0683493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0123  inner-membrane translocator  57.65 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  40.4 
 
 		 333 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.42 
 
 		 350 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  37.92 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  37.58 
 
 		 342 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 		 342 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.96 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  36.64 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.1 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.16 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 346 aa  169  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.16 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  37.42 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.06 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 309 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  35.06 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  35.57 
 
 		 333 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 		 835 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  32.44 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  33.91 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 328 aa  165  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  35.17 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  35.78 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.33 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.86 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  33.22 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  37.38 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  34.06 
 
 		 327 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  32.55 
 
 		 306 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.78 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  34.38 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.78 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.78 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.44 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.44 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  39.02 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  36.91 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  36.39 
 
 		 324 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  33.11 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2716  high-affinity D-ribose ABC transporter membrane protein  30.87 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0945  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  34.88 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 		 346 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  34.87 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  37.37 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  34.87 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  37.07 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4552  D-allose transporter subunit  33.88 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03958  D-allose transporter subunit  33.55 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3905  Monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03918  hypothetical protein  33.55 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1550  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  35.87 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  34.33 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  34.92 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3940  D-allose transporter subunit  33.55 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  35.47 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 336 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  36.73 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 383 aa  155  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  32.75 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  34.38 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  35.61 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.62 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  36.48 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1343  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  35.69 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.854381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  34.12 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 		 330 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 		 330 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>