More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4696 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4696  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 317 aa  594  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0367  carbohydrate ABC transporter permease  84.23 
 
 		 317 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0434  monosaccharide-transporting ATPase  84.23 
 
 		 317 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1228  carbohydrate ABC transporter permease  84.23 
 
 		 317 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.448635 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0389  sugar ABC transporter, permease protein  60.43 
 
 		 318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  51.96 
 
 		 316 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0348  sugar ABC transporter, permease protein  60.43 
 
 		 318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0395  sugar ABC transporter, permease protein  60.73 
 
 		 318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3721  inner-membrane translocator  48.52 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0783  monosaccharide-transporting ATPase  46.8 
 
 		 345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3401  monosaccharide-transporting ATPase  43.17 
 
 		 346 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3268  carbohydrate ABC transporter permease  43.17 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3562  inner-membrane translocator  43.23 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3636  inner-membrane translocator  45.13 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  41.72 
 
 		 334 aa  199  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4618  inner-membrane translocator  44.07 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921966 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5313  inner-membrane translocator  44.56 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  37.96 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3822  monosaccharide-transporting ATPase  40.21 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1335  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 353 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0781195  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4064  monosaccharide-transporting ATPase  41.32 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4656  monosaccharide-transporting ATPase  39.86 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.82 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  39.82 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  39.82 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1271  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.49 
 
 		 342 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.123363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4326  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2411  monosaccharide-transporting ATPase  37.22 
 
 		 359 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2310  carbohydrate ABC transporter permease  37.22 
 
 		 353 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  33.01 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5193  Monosaccharide-transporting ATPase  38.41 
 
 		 352 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1402  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.18 
 
 		 348 aa  158  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0354839  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.54 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4372  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82281  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  33.57 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  33.86 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 		 311 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 		 311 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.19 
 
 		 311 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.5 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 		 311 aa  156  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.19 
 
 		 311 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.84 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.84 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 314 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.54 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.77 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3317  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  35.15 
 
 		 348 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  33.44 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  33.22 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  33.44 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  31.01 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  31.96 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 		 335 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  34.18 
 
 		 335 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  31.97 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  32.92 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  34.32 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  34.32 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  33.86 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  31.01 
 
 		 334 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  32.92 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  31.01 
 
 		 334 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  35.12 
 
 		 349 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  32.52 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  33.13 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 334 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  31.91 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0424  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.34 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  33.11 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  38.97 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  33.44 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  32.78 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 		 835 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  33.44 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>