More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3652 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3652  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 333 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0860  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrD  99.7 
 
 		 333 aa  643    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3523  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrD  99.7 
 
 		 333 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  78.31 
 
 		 332 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  78.31 
 
 		 332 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  78.61 
 
 		 332 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  78.61 
 
 		 332 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  78.61 
 
 		 332 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2131  Monosaccharide-transporting ATPase  80.62 
 
 		 330 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.441175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1657  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  80.62 
 
 		 330 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.924695 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2143  monosaccharide-transporting ATPase  80.62 
 
 		 330 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2128  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  80.31 
 
 		 330 aa  495  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1597  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  80.62 
 
 		 330 aa  497  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0053  ABC transporter, permease, sugar transport  63.58 
 
 		 327 aa  417  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01472  AI2 transporter  78.91 
 
 		 265 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3534  inner-membrane translocator  69.51 
 
 		 327 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0938671 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3147  inner-membrane translocator  52.83 
 
 		 327 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.696622  normal  0.299191 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3501  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  52.52 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  43.48 
 
 		 329 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  42.64 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  42.64 
 
 		 338 aa  255  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  42.64 
 
 		 329 aa  255  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  42.64 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  42.64 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3013  ribose ABC transporter, permease protein, putative  44.1 
 
 		 329 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1715  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD, truncation  87.04 
 
 		 114 aa  185  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3014  putative ribose ABC transporter, permease protein  42.27 
 
 		 220 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.422083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2972  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  44.61 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000021735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  34.02 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  34.11 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  36.2 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  31.42 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  33.96 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.96 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  31.94 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  32.84 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  31.94 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  31.94 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 383 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0528  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  33.77 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  32.29 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.38 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  33.77 
 
 		 327 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.07 
 
 		 312 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  33.93 
 
 		 329 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  34.15 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  32.43 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  31.82 
 
 		 316 aa  133  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  30.33 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  31.58 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  32.34 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  29.24 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  34.02 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1676  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 849 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.586191 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.98 
 
 		 342 aa  129  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  31.14 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  31.86 
 
 		 333 aa  129  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  32.25 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  33 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  33.1 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.02 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  34.57 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 355 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  28.7 
 
 		 343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  29.67 
 
 		 342 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  29.67 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  29.67 
 
 		 342 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  30.03 
 
 		 345 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 345 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 345 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  31.66 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.72 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  30.03 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  34.85 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0883  Monosaccharide-transporting ATPase  34.59 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  32.74 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  31.27 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>