More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1676 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1676  inner-membrane translocator  100 
 
 
849 aa  1655    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.586191 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 
501 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.88 
 
 
501 aa  419  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  47.76 
 
 
499 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  45.08 
 
 
508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  41.38 
 
 
505 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  47.44 
 
 
504 aa  405  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  44.58 
 
 
511 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  41.55 
 
 
492 aa  398  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 
540 aa  399  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.12 
 
 
496 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 
517 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.62 
 
 
525 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  37.55 
 
 
493 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  43.54 
 
 
511 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  42.71 
 
 
511 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.96 
 
 
492 aa  389  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  42.6 
 
 
517 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  40.82 
 
 
494 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  46.6 
 
 
519 aa  389  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  42.54 
 
 
515 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
497 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  43.11 
 
 
517 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.27 
 
 
520 aa  386  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.42 
 
 
517 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.66 
 
 
517 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 
519 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  41.37 
 
 
495 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.42 
 
 
517 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.42 
 
 
517 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  41.09 
 
 
499 aa  382  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  43.88 
 
 
510 aa  382  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  43.33 
 
 
861 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.51 
 
 
522 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  43.66 
 
 
517 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  39.8 
 
 
496 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  43.86 
 
 
517 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  39.59 
 
 
496 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  41.97 
 
 
517 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  41.09 
 
 
499 aa  382  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  43.66 
 
 
517 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  43.86 
 
 
517 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  43.29 
 
 
519 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  42.8 
 
 
500 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.39 
 
 
494 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 
494 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  40.55 
 
 
503 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  41.55 
 
 
510 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  39.67 
 
 
497 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  40.86 
 
 
537 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  43.93 
 
 
497 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.94 
 
 
515 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  42.17 
 
 
511 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 
494 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.71 
 
 
508 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 
494 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 
494 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
497 aa  379  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  38.1 
 
 
499 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  41.72 
 
 
523 aa  379  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  40.73 
 
 
500 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  46.71 
 
 
500 aa  376  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 
494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 
494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  40.73 
 
 
502 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  40.4 
 
 
525 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  40 
 
 
516 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3483  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.04 
 
 
503 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 
494 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.97 
 
 
512 aa  376  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  41.82 
 
 
504 aa  376  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1180  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.84 
 
 
503 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  39.01 
 
 
506 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.07 
 
 
511 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  44.79 
 
 
498 aa  375  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.74 
 
 
515 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  45.4 
 
 
508 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  39.88 
 
 
501 aa  376  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  43.46 
 
 
517 aa  376  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2803  ABC transporter related  39.88 
 
 
501 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.74 
 
 
515 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  39.6 
 
 
494 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  44.1 
 
 
503 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  43.58 
 
 
505 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3447  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.04 
 
 
503 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.04 
 
 
503 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.06 
 
 
511 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.2 
 
 
506 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  42.59 
 
 
516 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 
506 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 
506 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  42.36 
 
 
514 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.18 
 
 
506 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  40.78 
 
 
524 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.09 
 
 
515 aa  373  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.68 
 
 
515 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  42.07 
 
 
513 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2242  ABC transporter related  39.27 
 
 
499 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  40.78 
 
 
524 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 
506 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>