More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6012 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  100 
 
 		 861 aa  1702    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  51.02 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  48.81 
 
 		 537 aa  477  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  51.36 
 
 		 508 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  49.69 
 
 		 505 aa  467  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  50.41 
 
 		 498 aa  468  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  46.43 
 
 		 510 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  47.12 
 
 		 503 aa  462  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  49.18 
 
 		 500 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  49.28 
 
 		 501 aa  458  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  47.81 
 
 		 514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  47.81 
 
 		 514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  48.16 
 
 		 519 aa  451  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  45.21 
 
 		 503 aa  452  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  45.92 
 
 		 511 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  48.97 
 
 		 509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  48.09 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  47.41 
 
 		 514 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.6 
 
 		 525 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  48.77 
 
 		 516 aa  445  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  45.27 
 
 		 511 aa  445  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  46.79 
 
 		 516 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.56 
 
 		 516 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  44.89 
 
 		 516 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 504 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 497 aa  439  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  47.24 
 
 		 499 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  43.67 
 
 		 500 aa  439  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.51 
 
 		 496 aa  435  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 		 523 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 494 aa  432  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 494 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 510 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  43.25 
 
 		 513 aa  432  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 		 494 aa  432  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 494 aa  432  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  43.06 
 
 		 525 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  45.29 
 
 		 495 aa  432  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  43.71 
 
 		 513 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.17 
 
 		 499 aa  432  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  42.68 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 494 aa  432  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 494 aa  428  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  43.11 
 
 		 501 aa  429  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  42.91 
 
 		 501 aa  428  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  42.2 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  43.85 
 
 		 521 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  44.27 
 
 		 515 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  42 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  44.35 
 
 		 519 aa  426  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.38 
 
 		 511 aa  426  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  40.44 
 
 		 504 aa  420  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.89 
 
 		 517 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  42.01 
 
 		 496 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.99 
 
 		 520 aa  422  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.52 
 
 		 495 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  42.01 
 
 		 496 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  42.63 
 
 		 524 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44.49 
 
 		 517 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  43.95 
 
 		 513 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  42.07 
 
 		 495 aa  422  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  42.86 
 
 		 500 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  43.06 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  40.8 
 
 		 512 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.51 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  43.24 
 
 		 524 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  44.35 
 
 		 497 aa  419  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  45.29 
 
 		 508 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  42.05 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.15 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.72 
 
 		 524 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  42.97 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 		 461 aa  415  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  43.11 
 
 		 504 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  42.48 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  43.34 
 
 		 522 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 500 aa  416  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.83 
 
 		 524 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.02 
 
 		 514 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.87 
 
 		 512 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.38 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.83 
 
 		 524 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  44.74 
 
 		 514 aa  416  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.42 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.83 
 
 		 524 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.87 
 
 		 512 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  45.86 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  43.49 
 
 		 502 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  43.38 
 
 		 516 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  41.43 
 
 		 504 aa  416  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  42.16 
 
 		 524 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  42.39 
 
 		 511 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  44.58 
 
 		 508 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  40.61 
 
 		 499 aa  416  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  41.78 
 
 		 518 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 		 512 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.45 
 
 		 494 aa  412  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 		 501 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>