More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1644 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  100 
 
 		 494 aa  994    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  49.49 
 
 		 523 aa  501  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.49 
 
 		 525 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  49.08 
 
 		 525 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  49.08 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  50.7 
 
 		 500 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  50.72 
 
 		 494 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  48.99 
 
 		 524 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  50.1 
 
 		 500 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.88 
 
 		 527 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  48.16 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  48.99 
 
 		 524 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  51.12 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  47.48 
 
 		 518 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  48.6 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  48.79 
 
 		 524 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  48.58 
 
 		 524 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  48.58 
 
 		 524 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  48.16 
 
 		 513 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  48.58 
 
 		 524 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  48.78 
 
 		 515 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  48.57 
 
 		 512 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  48.16 
 
 		 521 aa  478  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  49.18 
 
 		 503 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  47.76 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  51.02 
 
 		 501 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  48.88 
 
 		 496 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 		 494 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 		 494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  47.14 
 
 		 497 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  49.29 
 
 		 494 aa  467  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 494 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 		 494 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 494 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.67 
 
 		 515 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  47.55 
 
 		 513 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 494 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  49 
 
 		 501 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.8 
 
 		 494 aa  463  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.8 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  46.8 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  47.05 
 
 		 499 aa  463  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.46 
 
 		 515 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  48.2 
 
 		 504 aa  462  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  47.67 
 
 		 501 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  47.76 
 
 		 514 aa  458  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49.39 
 
 		 501 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  49.39 
 
 		 501 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  47.46 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1397  ABC transporter related  48.37 
 
 		 492 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0472986  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  48.39 
 
 		 504 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4065  ABC transporter related  48.16 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0517348  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  48.28 
 
 		 503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.36 
 
 		 506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 		 512 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.36 
 
 		 506 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  46.25 
 
 		 501 aa  451  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.77 
 
 		 512 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  46.96 
 
 		 503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  47.24 
 
 		 495 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  47.49 
 
 		 505 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  48.99 
 
 		 503 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  43.18 
 
 		 498 aa  446  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  47.07 
 
 		 512 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  45.01 
 
 		 511 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  46.46 
 
 		 513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  47.24 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  47.07 
 
 		 512 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  46.37 
 
 		 513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  47.07 
 
 		 514 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1576  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  46.14 
 
 		 499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  46.67 
 
 		 500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  49 
 
 		 525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.95 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 506 aa  443  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  45.95 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.6 
 
 		 492 aa  443  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1632  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.23 
 
 		 486 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  45.64 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 506 aa  445  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  46.65 
 
 		 497 aa  445  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 		 506 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 506 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 		 506 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  43.85 
 
 		 495 aa  444  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 		 506 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 		 506 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 502 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 		 506 aa  443  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.75 
 
 		 506 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  47.19 
 
 		 504 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  46.44 
 
 		 496 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  43.99 
 
 		 509 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.75 
 
 		 506 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  45.21 
 
 		 508 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>