More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6711 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  96.09 
 
 		 511 aa  994    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  75.19 
 
 		 516 aa  782    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  65.1 
 
 		 537 aa  640    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  68.09 
 
 		 503 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  80.94 
 
 		 511 aa  832    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  100 
 
 		 511 aa  1023    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  64.17 
 
 		 510 aa  660    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  57.23 
 
 		 500 aa  578  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  49.39 
 
 		 503 aa  492  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  48.41 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  46.04 
 
 		 516 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  45.51 
 
 		 518 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  45.85 
 
 		 524 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  47.18 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  46.06 
 
 		 524 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  45.23 
 
 		 524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  46.19 
 
 		 524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  44.56 
 
 		 515 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.21 
 
 		 527 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  47.56 
 
 		 505 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  45.02 
 
 		 524 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  45.02 
 
 		 524 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  46.49 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  43.58 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  45.92 
 
 		 861 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  48.47 
 
 		 498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 505 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2120  ABC transporter related  48.58 
 
 		 505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0246641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  46.91 
 
 		 512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  43.61 
 
 		 500 aa  442  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  44.83 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  42.66 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  47.29 
 
 		 516 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.62 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  44.11 
 
 		 494 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  43.24 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  44.7 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  44.96 
 
 		 515 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  44.62 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.35 
 
 		 516 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  45.3 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  45.45 
 
 		 495 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  44.62 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  44.62 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  44.62 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  44.42 
 
 		 516 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  44.51 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  45.4 
 
 		 504 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  47.04 
 
 		 525 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  44.42 
 
 		 501 aa  438  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  47.37 
 
 		 500 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  46.73 
 
 		 509 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  44.42 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  44.42 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  44.05 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  44.42 
 
 		 516 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  43.67 
 
 		 511 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  44.11 
 
 		 501 aa  435  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  44.92 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  44.72 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.15 
 
 		 514 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 497 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.15 
 
 		 514 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.45 
 
 		 514 aa  433  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.15 
 
 		 514 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 525 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  44.2 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  43.58 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  42.39 
 
 		 497 aa  428  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  43.41 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  43.87 
 
 		 513 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  46.19 
 
 		 508 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.25 
 
 		 499 aa  430  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44.18 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.83 
 
 		 520 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  42.86 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  45.3 
 
 		 521 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  43.37 
 
 		 507 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  44.81 
 
 		 499 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  44.94 
 
 		 510 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  45.62 
 
 		 495 aa  428  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  43.79 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  43.61 
 
 		 503 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  42.51 
 
 		 525 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  41.04 
 
 		 499 aa  422  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  43.7 
 
 		 501 aa  425  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  43.56 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  45.1 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.69 
 
 		 504 aa  423  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  43.67 
 
 		 495 aa  423  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  44.87 
 
 		 509 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  43.69 
 
 		 509 aa  421  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  43.29 
 
 		 501 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  41.83 
 
 		 523 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  44.11 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  45.97 
 
 		 519 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  44.13 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.24 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>